RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381218.8

ZBED1-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 2,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-201ENST00000381218 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 GJA10Q969M2 543 aa16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 GPCPD1Q9NPB8 672 aa16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 MCM8Q9UJA3 840 aa16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 KRT14P02533 472 aa16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 PDHBP11177 359 aa16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 IDEP14735 1019 aa16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 PDE6BP35913 854 aa16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 APBA1Q02410 837 aa16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 IFT88Q13099 833 aa16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 INF2Q27J81 1249 aa16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 HAUS4Q9H6D7 363 aa16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 DISC1Q9NRI5 854 aa16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 ROBO3Q96MS0 1386 aa16.81■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa16.8■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 GALNT17Q6IS24 598 aa16.8■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 TRIM47Q96LD4 638 aa16.8■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 SCLT1Q96NL6 688 aa16.8■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 TMEM60Q9H2L4 133 aa16.8■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 BARHL2Q9NY43 387 aa16.8■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 DAGLBQ8NCG7 672 aa16.8■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 STXBP3O00186 592 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 RPSAP08865 295 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 CEP85LQ5SZL2 805 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 SH3GL2Q99962 352 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 LRRC1Q9BTT6 524 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 FAM184BQ9ULE4 1060 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 ATP2C2O75185 946 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 UBA7P41226 1012 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 LZTS2Q9BRK4 669 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 MYH10P35580 1976 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 RASSF10A6NK89 507 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 LGALS16A8MUM7 142 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 KLRF2D3W0D1 207 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 FSBPO95073 299 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC40Q4G0X9 1142 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 TTBK2Q6IQ55 1244 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 SP8Q8IXZ3 490 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 HPS3Q969F9 1004 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 DNAJC7Q99615 494 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 MLXIPQ9HAP2 919 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF287Q9HBT7 754 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 H7C1D1 291 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 TRIM14Q14142 442 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 NAALADL2Q58DX5 795 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 KCTD1Q719H9 257 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 LRRC15Q8TF66 581 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 COA7Q96BR5 231 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 PIGSQ96S52 555 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 LRWD1Q9UFC0 647 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF263O14978 683 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 RAD17O75943 681 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 GDF11O95390 407 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 CDR1P51861 262 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 CDAN1Q8IWY9 1227 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC13Q8IYE1 715 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 ADSSL1Q8N142 457 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF507Q8TCN5 953 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 TMEM260Q9NX78 707 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 NPR1P16066 1061 aa16.77■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 DNA2P51530 1060 aa16.77■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 NAA35Q5VZE5 725 aa16.77■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 FAXDC2Q96IV6 333 aa16.77■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 CAPN11Q9UMQ6 739 aa16.77■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa16.77■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 SNED1Q8TER0 1413 aa16.77■□□□□ 0.28
ZBED1-201ENST00000381218 CLRN2A0PK11 232 aa16.77■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 LAD1O00515 517 aa16.77■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 NNTQ13423 1086 aa16.77■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 CCSER1Q9C0I3 900 aa16.77■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 KRT86O43790 486 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 OPA1O60313 960 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 NAPAP54920 295 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms