RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 OTOP2Q7RTS6 562 aa27.09■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 SESTD1Q86VW0 696 aa27.09■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 CUL5Q93034 780 aa27.09■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 TANC1Q9C0D5 1861 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 PIK3CDO00329 1044 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF286BP0CG31 522 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 PSEN2P49810 448 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 RCAN1P53805 252 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 PTGISQ16647 500 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 SPATA33Q96N06 139 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 CTAGE1Q96RT6 745 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 BCAS3Q9H6U6 928 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 RTEL1Q9NZ71 1219 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 BRPF3Q9ULD4 1205 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 NOD1Q9Y239 953 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-201ENST00000378543 GBF1Q92538 1859 aa27.07■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 F2P00734 622 aa27.07■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 ALG1Q9BT22 464 aa27.07■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM265A0A087WTH1 108 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 HAS3O00219 553 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 STAM2O75886 525 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 PSMA5P28066 241 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 PBX2P40425 430 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 SEMA3FQ13275 785 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 SLC17A8Q8NDX2 589 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 PSTPIP2Q9H939 334 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 MLXIPQ9HAP2 919 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 HDAC6Q9UBN7 1215 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 PITPNM1O00562 1244 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 PPFIA4O75335 1185 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 IQCF3P0C7M6 154 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 ICAM3P32942 547 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 MFSD10Q14728 455 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 GNPTABQ3T906 1256 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 DEFB128Q7Z7B8 93 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 FBXL16Q8N461 479 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 RETREG2Q8NC44 543 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 KATNAL1Q9BW62 490 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 PBX4Q9BYU1 374 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 SNX14Q9Y5W7 946 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 TET1Q8NFU7 2136 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 ZBTB43O43298 467 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 CPA1P15085 419 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA0753Q2KHM9 967 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 PCNX4Q63HM2 1172 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 C7orf31Q8N865 590 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 MYLIPQ8WY64 445 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 TIFAQ96CG3 184 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 BFSP2Q13515 415 aa27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 UBE2SQ16763 222 aa27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 RTN1Q16799 776 aa27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 FIBPO43427 364 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 PFKMP08237 780 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 FGD1P98174 961 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 FUT2Q10981 343 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 XRRA1Q6P2D8 792 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 C16orf70Q9BSU1 422 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-201ENST00000378543 RFC2P35250 354 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 NEDD9Q14511 834 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 WWC2Q6AWC2 1192 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 CYFIP1Q7L576 1253 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 TEX2Q8IWB9 1127 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 CAGE1Q8TC20 777 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF576Q9H609 170 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 GOLGA8AA7E2F4 631 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 GOLGA8BA8MQT2 603 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 ZBBXA8MT70 800 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 HIC1Q14526 733 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 GRIN2CQ14957 1233 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 METTL7BQ6UX53 244 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC155Q8N6L0 562 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 USP26Q9BXU7 913 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 TELO2Q9Y4R8 837 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 CDC27P30260 824 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 NLRX1Q86UT6 975 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 AFAP1L1Q8TED9 768 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 V9GY48 417 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms