RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF543Q08ER8 600 aa24.96■■□□□ 1.59
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HOXD1-201ENST00000331462 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD1-201ENST00000331462 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD1-201ENST00000331462 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXD1-201ENST00000331462 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD1-201ENST00000331462 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.95■■□□□ 1.59
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HOXD1-201ENST00000331462 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.95■■□□□ 1.58
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HOXD1-201ENST00000331462 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.95■■□□□ 1.58
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HOXD1-201ENST00000331462 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 GNA14O95837 355 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 TNNI2P48788 182 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC31Q6UY01 552 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 NOX5Q96PH1 765 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 RNF14Q9UBS8 474 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 ATAD5Q96QE3 1844 aa24.93■■□□□ 1.58
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HOXD1-201ENST00000331462 FAM26FQ5R3K3 315 aa24.93■■□□□ 1.58
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HOXD1-201ENST00000331462 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
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HOXD1-201ENST00000331462 CUL5Q93034 780 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 MTMR8Q96EF0 704 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC1Q9BTT6 524 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 TLR10Q9BXR5 811 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 SALL4Q9UJQ4 1053 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA6BA6NDN3 693 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 TTLL1O95922 423 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 AKR1B1P15121 316 aa24.93■■□□□ 1.58
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HOXD1-201ENST00000331462 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 MYO1CO00159 1063 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 NOL4O94818 638 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 SERPING1P05155 500 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 ADRA2BP18089 450 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC41Q15345 812 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.92■■□□□ 1.58
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HOXD1-201ENST00000331462 EMBQ6PCB8 327 aa24.92■■□□□ 1.58
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HOXD1-201ENST00000331462 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.92■■□□□ 1.58
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HOXD1-201ENST00000331462 HAUS3Q68CZ6 603 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
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HOXD1-201ENST00000331462 PANK4Q9NVE7 773 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM51Q9NW97 253 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 STIM2Q9P246 746 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 BBOX1O75936 387 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 CLSTN1O94985 981 aa24.91■■□□□ 1.58
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HOXD1-201ENST00000331462 TRIM59Q8IWR1 403 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.91■■□□□ 1.58
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HOXD1-201ENST00000331462 ZBTB9Q96C00 473 aa24.91■■□□□ 1.58
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HOXD1-201ENST00000331462 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC181Q5TID7 509 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 SFMBT2Q5VUG0 894 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 LCMT1Q9UIC8 334 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 NNTQ13423 1086 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC40Q4G0X9 1142 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
HOXD1-201ENST00000331462 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa24.89■■□□□ 1.58
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