RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL17AQ16552 155 aa30.97■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SOCS4Q8WXH5 440 aa30.97■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 AK8Q96MA6 479 aa30.97■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNH7Q9NS40 1196 aa30.97■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-201ENST00000318988 IGSF22Q8N9C0 903 aa30.92■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM160A1Q05DH4 1040 aa30.91■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PP2D1A8MPX8 630 aa30.87■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTGFP29279 349 aa30.87■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDC25AP30304 524 aa30.87■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 OTOP1Q7RTM1 612 aa30.87■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCSER1Q9C0I3 900 aa30.87■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HPSEQ9Y251 543 aa30.87■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa30.86■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
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