RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 ERO1BQ86YB8 467 aa23.7■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.7■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa23.7■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 MYMKA6NI61 221 aa23.69■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 MYL1P05976 194 aa23.69■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 ASIC1P78348 528 aa23.69■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 PPATQ06203 517 aa23.69■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 DRC7Q8IY82 874 aa23.69■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 C7orf25Q9BPX7 421 aa23.69■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 RMND1Q9NWS8 449 aa23.69■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 E9PMD0 336 aa23.68■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 MEIS1O00470 390 aa23.68■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 ITGB5P18084 799 aa23.68■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 DYMQ7RTS9 669 aa23.68■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.68■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 IFNKQ9P0W0 207 aa23.68■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.68■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 EML1O00423 815 aa23.68■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 HYIQ5T013 277 aa23.68■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.68■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.68■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 POTEFA5A3E0 1075 aa23.67■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.67■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 AMPD3Q01432 767 aa23.67■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 POTEGQ6S5H5 508 aa23.67■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.67■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 CHMP2AO43633 222 aa23.67■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 PRCPP42785 496 aa23.67■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 OAZ1P54368 228 aa23.67■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 HS1BP3Q53T59 392 aa23.67■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.67■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.67■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.67■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 PNMA2Q9UL42 364 aa23.67■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.67■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 PSMD10O75832 226 aa23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 RHOBTB3O94955 611 aa23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 FANCCQ00597 558 aa23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 CYP4A11Q02928 519 aa23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 KCNB1Q14721 858 aa23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 SLC5A5Q92911 643 aa23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 HPS3Q969F9 1004 aa23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 OPTNQ96CV9 577 aa23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 RMDN3Q96TC7 470 aa23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 ATP2A1O14983 1001 aa23.65■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 PSMC6P62333 389 aa23.65■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 PDE4DQ08499 809 aa23.65■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 PGM5Q15124 567 aa23.65■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.65■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 RGL1Q9NZL6 768 aa23.65■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 FCER1AP12319 257 aa23.65■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.65■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 PXMP2Q9NR77 195 aa23.65■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 MYPNQ86TC9 1320 aa23.65■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 GAS7O60861 476 aa23.64■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.64■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 ERMNQ8TAM6 284 aa23.64■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 DDX12PQ92771 950 aa23.64■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.64■■□□□ 1.38
RFXAP-201ENST00000255476 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
RFXAP-201ENST00000255476 RPA1P27694 616 aa23.64■■□□□ 1.37
RFXAP-201ENST00000255476 TERF1P54274 439 aa23.64■■□□□ 1.37
RFXAP-201ENST00000255476 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
RFXAP-201ENST00000255476 STK4Q13043 487 aa23.64■■□□□ 1.37
RFXAP-201ENST00000255476 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
RFXAP-201ENST00000255476 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
RFXAP-201ENST00000255476 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.64■■□□□ 1.37
RFXAP-201ENST00000255476 RRAGCQ9HB90 399 aa23.64■■□□□ 1.37
RFXAP-201ENST00000255476 EXOC1Q9NV70 894 aa23.64■■□□□ 1.37
RFXAP-201ENST00000255476 BTBD7Q9P203 1132 aa23.64■■□□□ 1.37
RFXAP-201ENST00000255476 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.64■■□□□ 1.37
RFXAP-201ENST00000255476 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
RFXAP-201ENST00000255476 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.63■■□□□ 1.37
RFXAP-201ENST00000255476 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF18P17022 549 aa23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms