RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 USP6NLQ92738 828 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 CCPG1Q9ULG6 757 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 FHOD1Q9Y613 1164 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 MYH6P13533 1939 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 GNRH1P01148 92 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 ELNP15502 786 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC27P30260 824 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF6Q15052 776 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 QRICH1Q2TAL8 776 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 KRBA2Q6ZNG9 492 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 REXO1L1PQ8IX06 675 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3TC2Q8TF17 1288 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 MROH8Q9H579 483 aa29.57■■■□□ 2.32
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB43O43298 467 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A27O95847 323 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 ICAM1P05362 532 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 PGK2P07205 417 aa29.56■■■□□ 2.32
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CAPNS1-201ENST00000246533 ATP1A3P13637 1013 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXD10P28358 340 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 OAZ1P54368 228 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 USH1GQ495M9 461 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGSQ96S52 555 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 RIOX1Q9H6W3 641 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 STX10O60499 249 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 COBLO75128 1261 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP29.55■■■□□ 2.32
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CAPNS1-201ENST00000246533 GRB14Q14449 540 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL14Q16627 93 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 TNS4Q8IZW8 715 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 RAET1EQ8TD07 263 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT12Q9BQG2 462 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 TADA3O75528 432 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 TRERF1Q96PN7 1200 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF146Q9NTX7 359 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
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CAPNS1-201ENST00000246533 CNNM3Q8NE01 707 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 NPLOC4Q8TAT6 608 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 MTMR8Q96EF0 704 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNH3Q9ULD8 1083 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 MYCP01106 439 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
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CAPNS1-201ENST00000246533 MLKLQ8NB16 471 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 NID2Q14112 1375 aa29.53■■■□□ 2.32
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CAPNS1-201ENST00000246533 FLRT1Q9NZU1 646 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC15A5A6NIM6 579 aa29.52■■■□□ 2.32
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CAPNS1-201ENST00000246533 CALM2P0DP24 149 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 CALM3P0DP25 149 aa29.52■■■□□ 2.32
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CAPNS1-201ENST00000246533 KIF5BP33176 963 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM32Q13049 653 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP2K5Q13163 448 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX35Q5T0J7 233 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 NT5DC1Q5TFE4 455 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 ADCY3O60266 1144 aa29.51■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 PNOCQ13519 176 aa29.51■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 KANK3Q6NY19 840 aa29.51■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 TMTC3Q6ZXV5 915 aa29.51■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa29.51■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 RTN1Q16799 776 aa29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM139Q8IV31 216 aa29.51■■■□□ 2.31
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CAPNS1-201ENST00000246533 TRIB2Q92519 343 aa29.5■■■□□ 2.31
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CAPNS1-201ENST00000246533 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 CASQ1P31415 396 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 GRK4P32298 578 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 PRMT2P55345 433 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD2Q14681 263 aa29.49■■■□□ 2.31
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