RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 NOD1Q9Y239 953 aa24.09■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 TMEM265A0A087WTH1 108 aa24.08■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.08■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.08■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 SORBS3O60504 671 aa24.08■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 RGS20O76081 388 aa24.08■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 DGKDQ16760 1214 aa24.08■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 Q6ZUG5 572 aa24.08■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 REV3LO60673 3130 aa24.08■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 PIK3CDO00329 1044 aa24.07■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 MEIS2O14770 477 aa24.07■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 PSMA5P28066 241 aa24.07■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 PBX2P40425 430 aa24.07■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 RASIP1Q5U651 963 aa24.07■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.07■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 USP38Q8NB14 1042 aa24.07■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.07■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 FGBP02675 491 aa24.06■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 RPS6KB1P23443 525 aa24.06■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 APOBRQ0VD83 1088 aa24.06■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 BRF1Q92994 677 aa24.06■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 SPATA33Q96N06 139 aa24.06■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 WNT8AQ9H1J5 351 aa24.06■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.06■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.06■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 GGPS1O95749 300 aa24.05■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 TGFB3P10600 412 aa24.05■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 RCAN1P53805 252 aa24.05■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 RETREG2Q8NC44 543 aa24.05■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 PPTC7Q8NI37 304 aa24.05■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 SCLYQ96I15 445 aa24.05■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 USP26Q9BXU7 913 aa24.05■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 ZNF576Q9H609 170 aa24.05■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.05■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.05■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 CDC27P30260 824 aa24.04■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 FUT2Q10981 343 aa24.04■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 GNPTABQ3T906 1256 aa24.04■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.04■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 KAT2BQ92831 832 aa24.04■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 TIFAQ96CG3 184 aa24.04■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 ALG1Q9BT22 464 aa24.04■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 PBX4Q9BYU1 374 aa24.04■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 MUC3AQ02505 3323 aa24.04■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 GBF1Q92538 1859 aa24.04■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 STAM2O75886 525 aa24.03■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 SP2Q02086 613 aa24.03■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 PTGISQ16647 500 aa24.03■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 OTOP2Q7RTS6 562 aa24.03■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 C7orf31Q8N865 590 aa24.03■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 TRANK1O15050 2925 aa24.03■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.02■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 PPFIA4O75335 1185 aa24.02■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 ZNF286BP0CG31 522 aa24.02■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 PSEN2P49810 448 aa24.02■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 UBE2SQ16763 222 aa24.02■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.02■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.02■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 FBXL16Q8N461 479 aa24.02■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 HERVK_113Q902F9 699 aa24.02■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 KATNAL1Q9BW62 490 aa24.02■■□□□ 1.44
CITED1-201ENST00000246139 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.01■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 NAPAP54920 295 aa24.01■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 BFSP2Q13515 415 aa24.01■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 MFSD10Q14728 455 aa24.01■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 HSDL1Q3SXM5 330 aa24.01■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.01■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 DEFB128Q7Z7B8 93 aa24.01■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.01■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 PRDM6Q9NQX0 595 aa24.01■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 ICAM3P32942 547 aa24■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 RUFY3Q7L099 469 aa24■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 VWCEQ96DN2 955 aa24■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.99■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 ZBBXA8MT70 800 aa23.99■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 FIBPO43427 364 aa23.99■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 NEDD9Q14511 834 aa23.99■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 NLRX1Q86UT6 975 aa23.99■■□□□ 1.43
CITED1-201ENST00000246139 SESTD1Q86VW0 696 aa23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 161.1 ms