RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.1■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 RAD54LQ92698 747 aa20.1■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.1■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 ACTN1P12814 892 aa20.1■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 GALNT17Q6IS24 598 aa20.1■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.1■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.1■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.1■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.1■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 LAD1O00515 517 aa20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 TLR2O60603 784 aa20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 CRY2Q49AN0 593 aa20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 EXOC4Q96A65 974 aa20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 POTEB2H3BUK9 544 aa20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 MAGEA1P43355 309 aa20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 CASP5P51878 434 aa20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 PSMC6P62333 389 aa20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 AMPD3Q01432 767 aa20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 KRT79Q5XKE5 535 aa20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 UNC13DQ70J99 1090 aa20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 BAP1Q92560 729 aa20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 COASYQ13057 564 aa20.08■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 SH2D4AQ9H788 454 aa20.08■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.08■□□□□ 0.81
PANX1-201ENST00000227638 POTEFA5A3E0 1075 aa20.08■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 AGPSO00116 658 aa20.08■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 POTEIP0CG38 1075 aa20.08■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 PDE4CQ08493 712 aa20.08■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.08■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 WDR93Q6P2C0 686 aa20.08■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 POTEGQ6S5H5 508 aa20.08■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.08■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 USP40Q9NVE5 1235 aa20.08■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.08■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 SNX12Q9UMY4 172 aa20.08■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 LY75O60449 1722 aa20.07■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 ATP2B4P23634 1241 aa20.07■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.07■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 IL1R1P14778 569 aa20.07■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 ACTN2P35609 894 aa20.07■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.07■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.07■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 PANK4Q9NVE7 773 aa20.07■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.07■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 HSPA1LP34931 641 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 MAN2A1Q16706 1144 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 USH1GQ495M9 461 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 CERS3Q8IU89 383 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 NUP58Q9BVL2 599 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 BCS1LQ9Y276 419 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 SFI1A8K8P3 1242 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 NOL4O94818 638 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 MYL1P05976 194 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 CYP4A11Q02928 519 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 HGSNATQ68CP4 663 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 CUEDC2Q9H467 287 aa20.06■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 POLD1P28340 1107 aa20.05■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.05■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 LRRC31Q6UY01 552 aa20.05■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 CERKQ8TCT0 537 aa20.05■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 TBC1D5Q92609 795 aa20.05■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.05■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.05■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 SHMT1P34896 483 aa20.05■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 ZNF543Q08ER8 600 aa20.05■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 TUBB2AQ13885 445 aa20.05■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.05■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 PROM2Q8N271 834 aa20.05■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.05■□□□□ 0.8
PANX1-201ENST00000227638 TLR10Q9BXR5 811 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms