RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mettl2Q8BMK1 389 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Stn1Q8K2X3 378 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ankrd54Q91WK7 299 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CutaQ9CQ89 177 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sapcd2Q9D818 391 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lamb1P02469 1786 aa6.54□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm3250E9Q1M3 230 aa6.54□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bard1O70445 765 aa6.54□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Parp2O88554 559 aa6.54□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cd72P21855 354 aa6.54□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CtshP49935 333 aa6.54□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atp11aP98197 1187 aa6.54□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Krtap10-4Q08EG8 221 aa6.54□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc85bQ6PDY0 202 aa6.54□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam109aQ8BH49 266 aa6.54□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pak4Q8BTW9 593 aa6.54□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 BroxQ8K2Q7 411 aa6.54□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ciao1Q99KN2 339 aa6.54□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sept12Q9D451 317 aa6.54□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hic2Q9JLZ6 619 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Astn1Q61137 1302 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PhipQ8VDD9 1821 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Palm3A2TJV2 734 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prss40A6H6T1 365 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P01648 108 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc4a1P04919 929 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Art2aP17981 287 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pde6bP23440 856 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sept4P28661 478 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dynll1P63168 89 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 St8sia5P70126 412 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rnpc3Q3UZ01 514 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc27Q3V036 639 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adora2aQ60613 410 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 BC080695Q66JY9 481 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pramel6Q810Y9 485 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nutm1Q8BHP2 1126 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpc2Q8BKV1 579 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Akr7a2Q8CG76 367 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myl6bQ8CI43 207 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mrpl58Q8R035 206 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Polr3glQ8R0C0 218 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wipi1Q8R3E3 446 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ca9Q8VHB5 437 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 QpctQ9CYK2 362 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Habp4Q9JKS5 411 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rgs20Q9QZB1 239 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adam11Q9R1V4 773 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mrvi1Q9WUX5 899 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klrc1Q9Z202 244 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Efcab12V9GXH0 673 aa6.53□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Plxnb3Q9QY40 1902 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kmt2bO08550 2713 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc23a4A0A0J9YUX7 615 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdc27A2A6Q5 825 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pet2A2AHY8 747 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem240B2RWJ3 173 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NudcO35685 332 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PdgfaP20033 211 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Il6stQ00560 917 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kmt5aQ2YDW7 349 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mum1l1Q4VA55 681 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Brip1Q5SXJ3 1174 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Usp17leQ7M764 540 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpbar1Q80SS6 329 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ift57Q8BXG3 429 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Defb36Q8K3U4 67 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpsm2Q8VDU0 679 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dnajc17Q91WT4 303 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atg13Q91YI1 516 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tas1r3Q925D8 858 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem39aQ9CYC3 486 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pla2g1bQ9Z0Y2 146 aa6.52□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rnf123Q5XPI3 1314 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Guca2bO09051 106 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adcy1O88444 1118 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hoxb1P17919 297 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fgfr2P21803 821 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mkl2P59759 1080 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 EnahQ03173 802 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Qrich1Q3UA37 777 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nlrp9aQ66X03 949 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prmt6Q6NZB1 378 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Exoc8Q6PGF7 716 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kctd3Q8BFX3 815 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trim6Q8BGE7 488 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cfap69Q8BH53 942 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NracQ8BNX7 165 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ssuh2Q8C3L1 340 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Phtf2Q8CB19 747 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tbc1d23Q8K0F1 684 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Unc5bQ8K1S3 945 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Apbb1ipQ8R5A3 670 aa6.51□□□□□ -1.37
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SharpinQ91WA6 380 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.8 ms