RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Plagl2Q925T4 496 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arl2bpQ9D385 163 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 FliiQ9JJ28 1271 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Myh7Q91Z83 1935 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rab21P35282 222 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nme8Q715T0 586 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rbm41Q8JZV4 413 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arhgap33Q80YF9 1305 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Serpina16D3Z660 418 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Myh2G3UW82 1942 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rad23bP54728 416 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Klra6Q60653 266 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Aggf1Q7TN31 711 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 FsbpQ8BKE5 299 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ildr1Q8CBR1 537 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lsm14bQ8CGC4 385 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Grin3bQ91ZU9 1003 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Atp6v1e2Q9D593 226 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ltbp1Q8CG19 1712 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fbf1A2A870 1173 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hnrnph3D3Z3N4 346 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ErmardE9Q048 622 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm21969J3QJZ1 289 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CrcpO35427 148 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eva1cP58659 440 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nyap1Q6PFX7 833 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 H6pdQ8CFX1 789 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eif4a3Q91VC3 411 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AslQ91YI0 464 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ttc14Q9CSP9 761 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Calml3Q9D6P8 149 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 WtapQ9ER69 396 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ube4aE9Q735 1028 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Atp2a2O55143 1044 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc4a4O88343 1079 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gnat1P20612 350 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NapbP28663 298 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 HlfQ8BW74 295 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pkd2l2Q9JLG4 621 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tada2bD3Z4Z0 420 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mapkapk5O54992 473 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Bnip3O55003 187 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ChkbO55229 394 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ncf2O70145 525 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cxcr2P35343 359 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rassf9Q8K342 435 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sept14Q9DA97 430 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Myh8P13542 1937 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Prss40A6H6T1 365 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trappc11B2RXC1 1133 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cpsf2O35218 782 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfp781Q0P5U5 243 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cyp24a1Q64441 514 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 SrlQ7TQ48 910 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Otop3Q80UF9 577 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rpa1Q8VEE4 623 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mettl13Q91YR5 698 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sf3a3Q9D554 501 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Myo1hQ9D6A1 958 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ParvgQ9ERD8 331 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sorbs3Q9R1Z8 733 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pnpla6Q3TRM4 1355 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Frmd7A2AD83 703 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Parp1P11103 1013 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lrrc43Q3V0L5 667 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Usp17leQ7M764 540 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 FtoQ8BGW1 502 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Spats2lQ91WJ7 558 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Akr1e2Q9DCT1 301 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Atp6v1g2Q9WTT4 118 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Znf394Q9Z1D9 521 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dynll1P63168 89 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ezh1P70351 747 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gjb4Q02738 266 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam83bQ0VBM2 1012 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CcnjlQ5SRT8 387 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Man2a2Q8BRK9 1152 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc13a4Q8BZ82 625 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lgi2Q8K4Z0 550 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 LpxnQ99N69 386 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ndufb9Q9CQJ8 179 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tob2Q9JM55 345 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pet2A2AHY8 747 aa18.9■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ankrd63A2ARS0 390 aa18.9■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Chrna9G3X8Z7 479 aa18.9■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 InhbeO08717 350 aa18.9■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pip4k2aO70172 405 aa18.9■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Birc5O70201 140 aa18.9■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tnni2P13412 182 aa18.9■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Usp4P35123 962 aa18.9■□□□□ 0.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 DSCC1Q14AI0 399 aa18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 76.3 ms