RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prune1Q8BIW1 454 aa22.08■■□□□ 1.13
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Ltb-201ENSMUST00000025262 1700129C05RikQ9CQ77 218 aa22.08■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Map3k20Q9ESL4 802 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm7086A0A1W2P766 342 aa22.07■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 PtproE9Q612 1226 aa22.07■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sec23aQ01405 765 aa22.07■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arhgef2Q60875 985 aa22.07■■□□□ 1.12
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa22.06■■□□□ 1.12
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Mboat4P0C7A3 435 aa22.06■■□□□ 1.12
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Q5XFZ0 217 aa22.05■■□□□ 1.12
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Ltb-201ENSMUST00000025262 LctF8VPT3 1931 aa22.05■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ttc6G3UYY4 1857 aa22.05■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm6133B2RY53 190 aa22.04■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp27b1O35084 507 aa22.04■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prl7a2O54831 253 aa22.04■■□□□ 1.12
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Cnnm2Q3TWN3 875 aa22.04■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nsrp1Q5NCR9 542 aa22.04■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dcaf8Q8N7N5 591 aa22.04■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Acat1Q8QZT1 424 aa22.04■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Krt84Q99M73 603 aa22.04■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mettl7bQ9DD20 244 aa22.04■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pgap3A2A559 320 aa22.03■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam209A2APA5 170 aa22.03■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dhtkd1A2ATU0 921 aa22.03■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kpna6O35345 536 aa22.03■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 SfnO70456 248 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rnf207Q3V3A7 635 aa22.03■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Grm4Q68EF4 912 aa22.03■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 NostrinQ6WKZ7 506 aa22.03■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Glis1Q8K1M4 789 aa22.03■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm5114W4VSN8 858 aa22.03■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prr22F6TNE3 422 aa22.02■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 MecomP14404 1042 aa22.02■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lbx1P52955 282 aa22.02■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Bpifa6Q0VGU8 367 aa22.02■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dennd1bQ3U1T9 766 aa22.02■■□□□ 1.12
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Colgalt2Q6NVG7 625 aa22.02■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cpa4Q6P8K8 420 aa22.02■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Camkk1Q8VBY2 505 aa22.02■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nxf1Q99JX7 618 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 SdhbQ9CQA3 282 aa22.02■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gcc1Q9D4H2 778 aa22.02■■□□□ 1.12
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Homer1Q9Z2Y3 366 aa22.02■■□□□ 1.12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp2f2P33267 491 aa22.01■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 LifrP42703 1092 aa22.01■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Antxr2Q6DFX2 487 aa22.01■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nrip1Q8CBD1 1161 aa22.01■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ushbp1Q8R370 680 aa22.01■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Clstn3Q99JH7 956 aa22.01■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zkscan2G3X952 960 aa22■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ppef2O35385 757 aa22■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Itgb5O70309 798 aa22■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mtco1P00397 514 aa22■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Jakmip3Q5DTN8 844 aa22■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pde3bQ61409 1100 aa22■■□□□ 1.11
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Umodl1Q5DID3 1319 aa22■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Myh8P13542 1937 aa22■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Col12a1Q60847 3120 aa21.99■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm4758L7N258 96 aa21.99■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nfil3O08750 462 aa21.99■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mov10P23249 1004 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Resp18P47939 175 aa21.99■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Smad4P97471 551 aa21.99■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q6P2K3 674 aa21.99■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc44a1Q6X893 653 aa21.99■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyfip1Q7TMB8 1253 aa21.99■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zmym6Q8BS54 1249 aa21.99■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rassf8Q8CJ96 419 aa21.99■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pold3Q9EQ28 462 aa21.99■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cnpy2Q9QXT0 182 aa21.99■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 ChgaP26339 463 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kcnj6P48542 425 aa21.98■■□□□ 1.11
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