RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)K

tK(UUU)K, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)K, Length 73 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)KtK(UUU)K MDM30Q05930 598 aa3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K YPR172WQ06608 200 aa3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K YOL019WQ08157 551 aa3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K NOB1Q08444 459 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K GYP1Q08484 637 aa3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K YLR049CQ12110 428 aa3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K UPC2Q12151 913 aa3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K YPL066WQ12194 479 aa3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K RPN5Q12250 445 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K PNS1Q12412 539 aa3.13□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K HOP09932 586 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K TY2A-LR1P0C2J4 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K COS2P0CX12 379 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K COS3P0CX13 379 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K TY2A-FP0CX61 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K TY2A-GR2P0CX62 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K BAS1P22035 811 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K RPB10P22139 70 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K AGP1P25376 633 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K CHA1P25379 360 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K TY2A-CP25383 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K TAH1P25638 111 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K RPC19P28000 142 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K CTS1P29029 562 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K SUI1P32911 108 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K FRE2P36033 711 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K CTP1P38152 299 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K YHR210CP38893 341 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K PAC1P39946 494 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K ARB1P40024 610 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K NEO1P40527 1151 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K COS4P43542 379 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data3.12□□□□□ -1.91not detected
tK(UUU)KtK(UUU)K YGL176CP46945 554 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K AIM22P47051 409 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K APS3P47064 194 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K NAS6P50086 228 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K YPT32P51996 222 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K MRM2P53123 320 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K FHN1P53279 174 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K IDP3P53982 420 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K ERG13P54839 491 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K AAT1Q01802 451 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K LGE1Q02796 332 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K TY2A-DR2Q03483 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K ECM11Q04110 302 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K ATG38Q05789 226 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K RIF2Q06208 395 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K TDA5Q06417 326 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K ENT4Q07872 247 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K NBA1Q08229 501 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K ESA1Q08649 445 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K MMT2Q08970 484 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K MLH3Q12083 715 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K RUP1Q12242 671 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K TY2A-BQ12260 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K TY2A-OR2Q12293 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K TY2A-DR1Q12392 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K TY2A-OR1Q12439 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K NOP58Q12499 511 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K PAR32Q12515 295 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K YOR032W-AQ8TGS1 66 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K TY2A-DR3Q99303 438 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K NUM1Q00402 2748 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K HFA1P32874 2273 aa3.12□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K CSF1Q12150 2958 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K COX1P00401 534 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K CAR1P00812 333 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K ARG4P04076 463 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K HXK2P04807 486 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K HTA2P04912 132 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K ATP4P05626 244 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K RPL7AP05737 244 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K CYT1P07143 309 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K NPR1P22211 790 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K APN1P22936 367 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K DBR1P24309 405 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K RVS161P25343 265 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K SLM5P25345 492 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K YCR102CP25608 368 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K YCR051WP25631 222 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K BUB2P26448 306 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K NUD1P32336 851 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K AAR2P32357 355 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K SSO1P32867 290 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K ATO2P32907 282 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K DOA1P36037 715 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K RRN3P36070 627 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K VRP1P37370 817 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K COS111P38308 924 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K SHU2P38957 223 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K SEC31P38968 1273 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K SER3P40054 469 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K ICE2P40499 491 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K AZF1P41696 914 aa3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K RPL10P41805 221 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K SEC26P41810 973 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 40 ms