RNA–Protein interactions for RNA: YOL033W

MSE1, Transcript of Mitochondrial glutamyl-tRNA synthetase, yeast

Gene MSE1, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSE1	YOL033W	NPR2	P39923	615 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	AVT6	P40074	448 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	LRO1	P40345	661 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	SER33	P40510	469 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	CHS6	P40955	746 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	THI6	P41835	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	QRI7	P43122	407 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	IRC7	P43623	340 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	RPC17	P47076	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	CTH1	P47976	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
MSE1	YOL033W	MRP51	Q02950	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	VHS1	Q03785	461 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	NSE1	Q07913	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	OPI10	Q08202	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	RAX1	Q08760	435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	ULA1	Q12059	462 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	CDC8	P00572	216 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	TPK1	P06244	397 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	DST1	P07273	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	COS2	P0CX12	379 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	COS3	P0CX13	379 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	MAS1	P10507	462 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	CLB2	P24869	491 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	PER1	P25625	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	PMT2	P31382	759 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	TFC1	P32367	649 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	PET127	P32606	800 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	TAE1	P38340	232 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	NVJ1	P38881	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	CYC2	P38909	366 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	CSM2	P40465	213 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	EFM4	P40516	257 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	SIP4	P46954	829 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	NMD5	P46970	1048 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	YJL045W	P47052	634 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	YGL159W	P53110	370 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	PKP2	P53170	491 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	YSA1	Q01976	231 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	SKY1	Q03656	742 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	CRR1	Q05790	422 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	YEH1	Q07804	573 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	MLH3	Q12083	715 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	ATG34	Q12292	412 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	NUP170	P38181	1502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	BNR1	P40450	1375 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSE1	YOL033W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	RAD18	P10862	487 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	SAM35	P14693	329 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	SNF6	P18888	332 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	SIR1	P21691	654 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	HXT2	P23585	541 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	LAC1	P28496	418 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	PRR1	P28708	518 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	PRE4	P30657	266 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	YSC84	P32793	468 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	GCS1	P35197	352 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	YBP1	P38315	674 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	YHR045W	P38775	560 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	ECM10	P39987	644 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	RPE1	P46969	238 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	RFX1	P48743	811 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	NBP35	P52920	328 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	UFD1	P53044	361 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	COG1	P53079	417 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	YGR053C	P53234	283 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	EEB1	Q02891	456 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSE1	YOL033W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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