RNA–Protein interactions for RNA: YMR134W

ERG29, Transcript of Protein of unknown function involved in ergosterol biosynthesis, yeast

Gene ERG29, Length 714 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ERG29	YMR134W	YAR066W	P0CX18	203 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	YHR214W	P0CX19	203 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	SPS22	P25380	463 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	TRS85	P46944	698 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	MRP51	Q02950	344 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	MUM2	P38236	366 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	YBR225W	P38321	900 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	PNG1	Q02890	363 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	FDH1	Q08911	376 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
ERG29	YMR134W	MID2	P36027	376 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	SLG1	P54867	378 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
ERG29	YMR134W	HUA2	Q12134	243 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	CDC16	P09798	840 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	MNS1	P32906	549 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	RIB5	P38145	238 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	FIN1	Q03898	291 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	RAD61	Q99359	647 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	PRD1	P25375	712 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	MST28	P39552	234 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	FLC2	P39719	783 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	SIM1	P40472	476 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
ERG29	YMR134W	VPS38	Q05919	439 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	NMD4	Q12129	218 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	CBP4	P37267	147 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	HXT11	P54862	567 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	MUM3	Q08750	479 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ERG29	YMR134W	TRP1	P00912	224 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	YCR041W	P37265	110 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	LAM5	P43560	674 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	SSN8	P47821	323 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	MEP3	P53390	489 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	MDG1	P53885	366 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	SOV1	Q04748	898 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	KKQ8	P36004	724 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	MRPL10	P36520	322 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	YJR008W	P47085	338 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	MTM1	P53320	366 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	YMR018W	Q04364	514 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	AVL9	Q12500	764 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	GAL80	P04387	435 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	BRO1	P48582	844 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	PPM1	Q04081	328 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	YHR131C	P38835	850 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	IOC4	Q04213	475 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	OPY2	Q06810	360 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	FUI1	P38196	639 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	YBR137W	P38276	179 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	YIP1	P53039	248 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	YGR066C	P53242	292 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	RRD2	Q12461	358 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	PEP3	P27801	918 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	NUP2	P32499	720 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	REG2	P38232	338 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	GAB1	P41733	394 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	IRC25	Q07951	179 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	POP5	P28005	173 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	SSU1	P41930	458 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	YGL108C	P53139	140 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	PCP1	P53259	346 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	TIM18	Q08749	192 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ERG29	YMR134W	ITR1	P30605	584 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	VID24	P38263	362 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	YMR181C	Q03231	154 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	PDS5	Q04264	1277 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	RCN2	Q12044	265 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	PET130	P47065	347 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	MRX6	P48564	524 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	CTI6	Q08923	506 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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