RNA–Protein interactions for RNA: YKL112W

ABF1, Transcript of DNA binding protein with possible chromatin-reorganizing activity, yeast

Gene ABF1, Length 2,196 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ABF1	YKL112W	BNA7	Q04066	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	TFC6	Q06339	672 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	CTS2	Q06350	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	SWT1	Q12104	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	IES3	Q12345	250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	YDL206W	Q12424	762 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	RAM1	P22007	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	AMD2	P22580	549 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	PCL2	P25693	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	MSS51	P32335	436 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	CYM1	P32898	989 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	ELF1	P36053	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	FES1	P38260	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	SFB3	P38810	929 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	YER121W	P40076	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	CHS6	P40955	746 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	SAD1	P43589	448 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	YFR018C	P43599	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	RPA14	P50106	137 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	NBP35	P52920	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	VPS75	P53853	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	CTF19	Q02732	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	ROD1	Q02805	837 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	SWF1	Q04629	336 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	MHR1	Q06630	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	RSB1	Q08417	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	UBX3	Q12229	455 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	MSF1	P08425	469 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	RPB10	P22139	70 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	PEX3	P28795	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	FAT1	P38225	669 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	YBR197C	P38306	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	TSC10	P38342	320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	SBE22	P38814	852 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	UBA4	P38820	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	AIM24	P47127	394 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	YGL159W	P53110	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	TAF10	Q12030	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	ATG9	Q12142	997 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	VPS63	O13549	108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	YER152C	P10356	443 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	PCK1	P10963	549 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	ERV1	P27882	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	RFC5	P38251	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	PRE3	P38624	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	CYC2	P38909	366 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	LYS9	P38999	446 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	SSU1	P41930	458 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	IDS2	P46958	469 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	YJR054W	P47114	497 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	PKP2	P53170	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	YGR273C	P53329	174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	BUD17	P53727	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	GIS4	Q04233	774 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	ROY1	Q04847	553 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	DCS2	Q12123	353 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	PCT1	P13259	424 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	CBS2	P14905	389 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	RRT12	P25381	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	ISC10	P32645	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	GEX2	P36173	615 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	AGP2	P38090	596 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	ACO2	P39533	789 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	DDI1	P40087	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	YKE4	P40544	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	RTT101	P47050	842 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	VOA1	P53262	265 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABF1	YKL112W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected

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