RNA–Protein interactions for RNA: YHR065C

RRP3, Transcript of Protein involved in rRNA processing, yeast

Gene RRP3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP3	YHR065C	PTC1	P35182	281 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YKL151C	P36059	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	GMH1	P36125	273 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	CAF4	P36130	643 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	CYC2	P38909	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	CCT6	P39079	546 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SER33	P40510	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	COS4	P43542	379 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	TIS11	P47977	285 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YGR053C	P53234	283 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ZRG17	P53735	605 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YDR476C	Q03362	224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ACL4	Q03771	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	HFD1	Q04458	532 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	RSC3	Q06639	885 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ATP6	P00854	259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	VPS34	P22543	875 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ATP7	P30902	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ZIP1	P31111	875 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YBL029W	P38201	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YHR078W	P38799	552 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	GDH3	P39708	457 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	MPS3	P47069	682 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	MPS2	P53159	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	VHS1	Q03785	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SGT1	Q08446	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SUC2	P00724	532 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	INH1	P01097	85 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	TPK2	P06245	380 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	STE3	P06783	470 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	CDC21	P06785	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YSR3	P23501	404 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	OCA4	P25366	362 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	TFC1	P32367	649 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
RRP3	YHR065C	HES1	P35843	434 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	GIC1	P38785	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	MAM33	P40513	266 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	IMA5	P40884	581 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	STB2	P46679	850 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	DIA3	P52290	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	MDM34	P53083	459 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ERP6	P53198	216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YNR061C	P53747	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YNL260C	P53846	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	MMT1	Q03218	510 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	RSM24	Q03976	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ECM11	Q04110	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	HSP31	Q04432	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	DYN3	Q04949	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	RAD34	Q06665	692 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	PHO81	P17442	1178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SAN1	P22470	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	STE14	P32584	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SDH3	P33421	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	IST2	P38250	946 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	BMT2	P38278	337 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	MET12	P46151	657 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YJR149W	P47177	404 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	GTO1	P48239	356 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YGR015C	P53208	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	COS6	P53344	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
RRP3	YHR065C	IRC15	Q02733	499 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	EMI1	Q04406	187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YDR124W	Q04608	324 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ARG7	Q04728	441 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SPR28	Q04921	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ATG10	Q07879	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	MUM3	Q08750	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	VPS68	Q12016	184 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	HUA2	Q12134	243 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	PST1	Q12355	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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