RNA–Protein interactions for RNA: YHL007C

STE20, Transcript of Cdc42p-activated signal transducing kinase, yeast

Gene STE20, Length 2,820 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE20	YHL007C	CTP1	P38152	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	YEL068C	P39977	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	AIM24	P47127	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	AZR1	P50080	613 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	AIM14	P53109	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	YPR003C	P53394	754 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	SSY1	Q03770	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	TVP15	Q03860	143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	YLR053C	Q12026	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	YDR262W	Q12331	272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	GCN3	P14741	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	IFM1	P25038	676 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	GEX1	P25596	615 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	TMT1	P32643	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	SEN34	P39707	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	LRO1	P40345	661 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	MSE1	P48525	536 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	CUL3	P53202	744 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	NHP10	Q03435	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	ARG7	Q04728	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	MFB1	Q04922	465 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	SUE1	Q06524	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	YPR091C	Q06833	770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	MCH5	Q08777	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	FRE5	Q08908	694 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	OXR1	Q08952	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	ULA1	Q12059	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	ATG34	Q12292	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	GLO4	Q12320	285 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	LDB19	Q12502	818 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	BI2	P03873	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	HOP1	P20050	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	RHB1	P25378	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	DAL3	P32459	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	MKK2	P32491	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	YAT1	P80235	687 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	FAR10	Q06001	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	RFU1	Q08003	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	OPI10	Q08202	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	RAX1	Q08760	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	SEM1	O94742	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	RAD18	P10862	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	GAL2	P13181	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	SRB2	P34162	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	GLG1	P36143	616 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	ETR1	P38071	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	FES1	P38260	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	UBX7	P38349	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	YJL206C	P39529	758 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	AVT6	P40074	448 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	QDR1	P40475	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	YJL045W	P47052	634 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	MTC3	P53077	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	USE1	P53146	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	VAC7	P53950	1165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	OSH6	Q02201	448 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	PEX29	Q03370	554 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	SKY1	Q03656	742 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	PEX15	Q08215	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	TRM11	Q12463	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	MET2	P08465	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
STE20	YHL007C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	SOK1	P40317	901 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	PRM2	P40534	656 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	YJL132W	P47014	750 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	CTR1	P49573	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	ATP25	Q03153	612 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	AIM32	Q04689	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	YEH1	Q07804	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STE20	YHL007C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 69.5 ms