RNA–Protein interactions for RNA: YGR063C

SPT4, Transcript of Component of the universally conserved Spt4/5 complex (DSIF complex), yeastyeast

Gene SPT4, Length 309 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT4YGR063C CUS2P53830 285 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data3.41□□□□□ -1.86not detected
SPT4YGR063C TIM44Q01852 431 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C RPS15Q01855 142 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C ENA2Q01896 1091 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C CWC27Q02770 301 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C UBP16Q02863 499 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C PRM15Q03262 622 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C NGL2Q03264 515 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C YDR387CQ04162 555 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C YDR109CQ04585 715 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C SMA2Q04658 369 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C PRM6Q04705 352 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C MFB1Q04922 465 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C HDA3Q06623 655 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C CDA2Q06703 312 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C YET3Q07451 203 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C WHI4Q07655 649 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C BDS1Q08347 646 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C AAD15Q08361 143 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C YRR1Q12172 810 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C HAL9Q12180 1030 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C YOR022CQ12204 715 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C RPN5Q12250 445 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C SVS1Q12254 260 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C MED1Q12321 566 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C RTN2Q12443 393 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C ENA5Q12691 1091 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C YPL119C-AQ3E751 87 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT4YGR063C BI4P03879 638 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PHO4P07270 312 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C GCD1P09032 578 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YFR010W-AP0C5N0 62 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YEL076C-AP0CX16 216 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YLR464WP0CX17 216 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C HOM3P10869 527 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C FUS3P16892 353 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MRPL44P19956 98 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PHO80P20052 293 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SLY1P22213 666 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MAK31P23059 88 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RPL24BP24000 155 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C DAL80P26343 269 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C URA7P28274 579 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C CTS1P29029 562 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C LDS1P31379 325 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C FUN26P31381 517 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C BIO2P32451 375 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PHA2P32452 334 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ECM25P32525 599 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SRB6P32570 121 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C UTR4P32626 227 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C GLC3P32775 704 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C FRE1P32791 686 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C UGA4P32837 571 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PDC2P32896 925 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RPT3P33298 428 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YKL077WP36081 392 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C KAE1P36132 386 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PET10P36139 283 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MRPL15P36523 253 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C VRP1P37370 817 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C CHK1P38147 527 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YBL086CP38177 466 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C NCL1P38205 684 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C IST2P38250 946 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MSC7P38694 644 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C DED81P38707 554 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C GEP4P38812 185 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YHR182WP38870 785 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C NVJ1P38881 321 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RAD55P38953 406 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C GIP4P39732 760 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RSP5P39940 809 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YEL076CP39971 216 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PCL6P40038 420 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C TOK1P40310 691 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PEP8P40335 379 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SWM2P40342 146 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YIL024CP40543 189 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YIR035CP40579 254 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C MRPS18P42847 217 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C SLS1P42900 643 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PMT4P46971 762 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YML6P51998 286 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C DIA3P52290 468 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YGL117WP53133 265 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C PEX8P53248 589 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C RSM27P53305 110 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ARE2P53629 642 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C DSE4P53753 1117 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YNL033WP53964 284 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YNL019CP53975 284 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C STP1Q00947 519 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C YPL071CQ02864 156 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C ELP3Q02908 557 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPT4YGR063C HAS1Q03532 505 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.9 ms