RNA–Protein interactions for RNA: YDR057W

YOS9, Transcript of ER quality-control lectin, yeast

Gene YOS9, Length 1,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOS9	YDR057W	GLO2	Q05584	274 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	VTA1	Q06263	330 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	MHR1	Q06630	226 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	WTM2	Q12206	467 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	ATP6	P00854	259 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	DTR1	P38125	572 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	FET3	P38993	636 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	MSS4	P38994	779 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	UME6	P39001	836 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	ECM10	P39987	644 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YKE4	P40544	346 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	TOS3	P43637	560 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YGL176C	P46945	554 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	IDS2	P46958	469 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	NBP35	P52920	328 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	TAF6	P53040	516 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YGL185C	P53100	379 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	MSC2	Q03455	724 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	FAR10	Q06001	478 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	XYL2	Q07993	356 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YLR108C	Q12259	485 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	EMP46	Q12396	444 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	ATG31	Q12421	196 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	AGC1	Q12482	902 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	SNF8	Q12483	233 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	SWI5	P08153	709 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	MAS1	P10507	462 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	CSM1	P25651	190 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	MNS1	P32906	549 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YKL071W	P36086	256 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	GIP1	P38229	639 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	SPC97	P38863	823 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YIR007W	P40566	764 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	MET28	P40573	187 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	PPT1	P53043	513 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	GIS1	Q03833	894 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	NMD4	Q12129	218 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	PET20	Q99373	253 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	REV3	P14284	1504 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	CDC8	P00572	216 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	HVG1	P0CE11	249 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	SNA3	P14359	133 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RIT1	P23796	513 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	SNT1	P25357	1226 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	GSH1	P32477	678 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	DOA1	P36037	715 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	GID8	P40208	455 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	BUD17	P53727	317 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	YAT1	P80235	687 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RIM13	Q03792	727 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	AIM33	Q04516	312 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	BSC6	Q08280	497 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RAX1	Q08760	435 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	RCN2	Q12044	265 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	AFI1	Q99222	893 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	MET2	P08465	486 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	SCO2	P38072	301 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YOS9	YDR057W	DUG2	P38149	878 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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