RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.54■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 CLIC6Q96NY7 704 aa22.54■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.54■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 POLR2MP0CAP2 368 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 ERVK-9P63128 1117 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 ERVK-24P63145 666 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 TPM4P67936 248 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 TKFCQ3LXA3 575 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 SMTNL1A8MU46 457 aa22.52■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 PIK3CDO00329 1044 aa22.52■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 NEMFO60524 1076 aa22.52■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 LRMPQ12912 555 aa22.52■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.52■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.52■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.52■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 BIN1O00499 593 aa22.52■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 ATP2B1P20020 1258 aa22.52■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.52■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 ACAD9Q9H845 621 aa22.52■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.52■■□□□ 1.2
CLN8-208ENST00000635751 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 INF2Q27J81 1249 aa22.51■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 NSMFQ6X4W1 530 aa22.51■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.51■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 CHST13Q8NET6 341 aa22.51■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.51■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.51■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 DYNC1I1O14576 645 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 ERCC3P19447 782 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 HSD17B4P51659 736 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 SLC25A27O95847 323 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 PTPREP23469 700 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 VEGFBP49765 207 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 AP3B2Q13367 1082 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 TBCKQ8TEA7 893 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 IKBKBO14920 756 aa22.49■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 GHRHRQ02643 423 aa22.49■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.49■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.49■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 CNNM3Q8NE01 707 aa22.49■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 ANO3Q9BYT9 981 aa22.49■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 CPA4Q9UI42 421 aa22.49■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 LCTP09848 1927 aa22.49■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 WNT7AO00755 349 aa22.48■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 PNOCQ13519 176 aa22.48■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 MCTP2Q6DN12 878 aa22.48■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.48■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 PORCNQ9H237 461 aa22.48■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 COL20A1Q9P218 1284 aa22.48■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 FBXO40Q9UH90 709 aa22.48■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.48■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 PLXNB2O15031 1838 aa22.48■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 LONRF3Q496Y0 759 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 PCNTO95613 3336 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 CCNA1P78396 465 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 CRHR2Q13324 411 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 NCAPHQ15003 741 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 WDR78Q5VTH9 848 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 EFCC1Q9HA90 598 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.47■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 TLR2O60603 784 aa22.46■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 COPB2P35606 906 aa22.46■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 TRAPPC10P48553 1259 aa22.46■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 GSDMDP57764 484 aa22.46■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 TTC38Q5R3I4 469 aa22.46■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 NEK8Q86SG6 692 aa22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms