RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PTPN22Q9Y2R2 807 aa16.56■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WNT7AO00755 349 aa16.55■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRMT2P55345 433 aa16.55■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IRF5Q13568 498 aa16.55■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STXBP2Q15833 593 aa16.55■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCNX4Q63HM2 1172 aa16.55■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OLFML2BQ68BL8 750 aa16.55■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IWS1Q96ST2 819 aa16.55■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CNPY2Q9Y2B0 182 aa16.55■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HTTP42858 3142 aa16.55■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa16.54■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HMGCRP04035 888 aa16.54■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 INHAP05111 366 aa16.54■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EDNRBP24530 442 aa16.54■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CNGA1P29973 690 aa16.54■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GRK4P32298 578 aa16.54■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa16.54■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRR16Q569H4 304 aa16.54■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TTC38Q5R3I4 469 aa16.54■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BRAPQ7Z569 592 aa16.54■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLAIN1Q8ND83 568 aa16.54■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WDR11Q9BZH6 1224 aa16.54■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BRD1O95696 1058 aa16.53■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MCM7P33993 719 aa16.53■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF174Q15697 407 aa16.53■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYSM1Q5VVJ2 828 aa16.53■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANO1Q5XXA6 986 aa16.53■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TEX2Q8IWB9 1127 aa16.53■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYP2W1Q8TAV3 490 aa16.53■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDGFCQ9NRA1 345 aa16.53■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZDHHC9Q9Y397 364 aa16.53■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM86B1E9PN63 330 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC37A4O43826 429 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM86B2P0C5J1 330 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NCLP19338 710 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PTGS1P23219 599 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DDIT3P35638 169 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADCYAP1R1P41586 468 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MTMR1Q13613 665 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ACVR2BQ13705 512 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NLRX1Q86UT6 975 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VSIG10LQ86VR7 867 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLA2G4DQ86XP0 818 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POTEDQ86YR6 584 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CHAMP1Q96JM3 812 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MXRA8Q9BRK3 442 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VTA1Q9NP79 307 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MRVI1Q9Y6F6 885 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FRMPD3Q5JV73 1810 aa16.52■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MARCH6O60337 910 aa16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ITGB5P18084 799 aa16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NUCB2P80303 420 aa16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GNPTABQ3T906 1256 aa16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CEP55Q53EZ4 464 aa16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRPV1Q8NER1 839 aa16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MORC4Q8TE76 937 aa16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CRYGNQ8WXF5 182 aa16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GJA10Q969M2 543 aa16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CHMP5Q9NZZ3 219 aa16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CENPFP49454 3210 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EDIL3O43854 480 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NEMFO60524 1076 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RGS20O76081 388 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYP3A4P08684 503 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARP10275 920 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYBAP13498 195 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP11P51784 963 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SP4Q02446 784 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC144BQ3MJ40 725 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RILPL1Q5EBL4 403 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM63BQ5T3F8 832 aa16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms