RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599658.1

LSR-208, Transcript of lipolysis stimulated lipoprotein receptor, human

TSL 3

Gene LSR, Length 343 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LSR-208	ENST00000599658	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.78	□□□□□ -0.2
LSR-208	ENST00000599658	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.78	□□□□□ -0.2
LSR-208	ENST00000599658	ZNF576	Q9H609	170 aa		13.78	□□□□□ -0.2
LSR-208	ENST00000599658	CDH23	Q9H251	3354 aa		13.77	□□□□□ -0.2
LSR-208	ENST00000599658	TROAP	Q12815	778 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	KAT2B	Q92831	832 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	ZBBX	A8MT70	800 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	KPNA6	O60684	536 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	RGS20	O76081	388 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	RABGGTB	P53611	331 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	PGM5	Q15124	567 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	MAF1	Q9H063	256 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	PTPRS	Q13332	1948 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	MYOG	P15173	224 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	GHRHR	Q02643	423 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	LY9	Q9HBG7	655 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	EYS	Q5T1H1	3165 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	PRC1	O43663	620 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	RXRA	P19793	462 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	PTGIS	Q16647	500 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	PPM1E	Q8WY54	764 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	MSRA	Q9UJ68	235 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	SLC27A2	O14975	620 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	PSEN2	P49810	448 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	SP2	Q02086	613 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	RAB30	Q15771	203 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	DGKD	Q16760	1214 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	RETREG2	Q8NC44	543 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658		A0A0C4DFX4	3053 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	GGPS1	O95749	300 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	CCND2	P30279	289 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	LAMC2	Q13753	1193 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	MFSD10	Q14728	455 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	CASC1	Q6TDU7	716 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	PITPNM1	O00562	1244 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	DDAH1	O94760	285 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	BFSP2	Q13515	415 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LSR-208	ENST00000599658	ADGRE1	Q14246	886 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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