RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591856.1

EFTUD2-221, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-221ENST00000591856 GPRASP2Q96D09 838 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 MBOAT7Q96N66 472 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 CEP290O15078 2479 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 ADCY6O43306 1168 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 EDIL3O43854 480 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 DTNBO60941 627 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 GJB1P08034 283 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 CCL5P13501 91 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 ICAM3P32942 547 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 KRT2P35908 639 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 ARHGAP4P98171 946 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 CCDC62Q6P9F0 684 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 OXER1Q8TDS5 423 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 LENG9Q96B70 501 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 TMEM260Q9NX78 707 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 Q9Y3F1 56 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 MEIS1O00470 390 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 FIBPO43427 364 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 TGFB3P10600 412 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 ITGB5P18084 799 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 CYP3A7P24462 503 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 CST5P28325 142 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 USP11P51784 963 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 SEMA3FQ13275 785 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 NR5A1Q13285 461 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 MTFR1Q15390 333 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 CCDC144BQ3MJ40 725 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 GNPTABQ3T906 1256 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 DUSP28Q4G0W2 176 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 CEP55Q53EZ4 464 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 LHX8Q68G74 356 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 IQSEC1Q6DN90 963 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 ABHD8Q96I13 439 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 CDHR1Q96JP9 859 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 PGBD1Q96JS3 809 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 ALPK3Q96L96 1907 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-221ENST00000591856 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 BTBD18B2RXH4 712 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 KIF28PB7ZC32 967 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM86B1E9PN63 330 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 MAFGO15525 162 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 ADAMTS4O75173 837 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 ARIH2O95376 493 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM86B2P0C5J1 330 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 SMPD1P17405 629 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 GJA8P48165 433 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 TRAPPC10P48553 1259 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 BECN1Q14457 450 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 TTLL4Q14679 1199 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 PPP4R3AQ6IN85 833 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 TNS4Q8IZW8 715 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 TBCKQ8TEA7 893 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 MXRA8Q9BRK3 442 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 RNF208Q9H0X6 261 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 JADE2Q9NQC1 790 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 PDGFCQ9NRA1 345 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 OGDHLQ9ULD0 1010 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-221ENST00000591856 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms