RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 MCF2L2Q86YR7 1114 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 CAGE1Q8TC20 777 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 AFAP1L1Q8TED9 768 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 IWS1Q96ST2 819 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 REV3LO60673 3130 aa29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 XIRP2A4UGR9 3374 aa29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNQ1P51787 676 aa29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC155Q8N6L0 562 aa29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 JMJD4Q9H9V9 463 aa29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSWIM5Q9P217 1185 aa29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa29.94■■■□□ 2.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 CASTP20810 708 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC8DQ7L1W4 858 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 CHD1LQ86WJ1 897 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO11Q86XK2 927 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 OSBPL3Q9H4L5 887 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 VAT1LQ9HCJ6 419 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF28PB7ZC32 967 aa29.93■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR5P61964 334 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 OPLAHO14841 1288 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 TLL1O43897 1013 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 SELPP16109 830 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 DGKDQ16760 1214 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 PXMP2Q9NR77 195 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 HDAC6Q9UBN7 1215 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 LCHNA4D1U4 455 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNJ6P48051 423 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 RBL2Q08999 1139 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 AAK1Q2M2I8 961 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 TCTN1Q2MV58 587 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 DSCC1Q9BVC3 393 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 TET1Q8NFU7 2136 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 NBNO60934 754 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 CFBP00751 764 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 NR3C2P08235 984 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF286BP0CG31 522 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 CKBP12277 381 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 PSEN2P49810 448 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB103AP81534 67 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 NUCB1Q02818 461 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 GRB10Q13322 594 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 STAG2Q8N3U4 1231 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 ALG1Q9BT22 464 aa29.9■■■□□ 2.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 CXCL10P02778 98 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 HSD17B4P51659 736 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 C7orf31Q8N865 590 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPRSQ13332 1948 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 LPXNO60711 386 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 F2P00734 622 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD10Q14728 455 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CNKSR3Q6P9H4 555 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PPTC7Q8NI37 304 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 UBAC1Q9BSL1 405 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 AMNQ9BXJ7 453 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
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CAPNS1-211ENST00000590874 GHRHRQ02643 423 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMC2Q13753 1193 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA0753Q2KHM9 967 aa29.87■■■□□ 2.37
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CAPNS1-211ENST00000590874 KATNAL1Q9BW62 490 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT23Q9C075 422 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 IL25Q9H293 177 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 HIP1O00291 1037 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS20O76081 388 aa29.86■■■□□ 2.37
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CAPNS1-211ENST00000590874 AAMPQ13685 434 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAF7Q6Q0C0 670 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PDCD2LQ9BRP1 358 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 TRANK1O15050 2925 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SORBS3O60504 671 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PTK7Q13308 1070 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 MTMR8Q96EF0 704 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBED2Q9BTP6 218 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CNNM2Q9H8M5 875 aa29.85■■■□□ 2.37
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