RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 AP3B2Q13367 1082 aa23.04■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 IQSEC1Q6DN90 963 aa23.04■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 BICD2Q8TD16 824 aa23.04■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.04■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.04■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.04■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 ADCY6O43306 1168 aa23.03■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 JAK2O60674 1132 aa23.03■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 TNFAIP2Q03169 654 aa23.03■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.03■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 SCFD2Q8WU76 684 aa23.03■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa23.03■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 DTNBO60941 627 aa23.02■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 XBP1P17861 261 aa23.02■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 PDCP20941 246 aa23.02■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 NLRP5P59047 1200 aa23.02■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 IFFO2Q5TF58 517 aa23.02■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.02■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 MCTP2Q6DN12 878 aa23.02■■□□□ 1.28
ATG4D-208ENST00000588667 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.02■■□□□ 1.28
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ATG4D-208ENST00000588667 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.01■■□□□ 1.27
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ATG4D-208ENST00000588667 ALG1Q9BT22 464 aa23.01■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 KIF3AQ9Y496 699 aa23.01■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.01■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.01■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 SMPD1P17405 629 aa23■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 PKP1Q13835 747 aa23■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 TTLL4Q14679 1199 aa23■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 DUSP28Q4G0W2 176 aa23■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 GALNT17Q6IS24 598 aa23■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 SEPT14Q6ZU15 432 aa23■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 ANO3Q9BYT9 981 aa23■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 TMEM260Q9NX78 707 aa23■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 BRD1O95696 1058 aa23■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 RGS19P49795 217 aa23■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 DAGLBQ8NCG7 672 aa23■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 PCDHA4Q9UN74 947 aa23■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 DNM1LO00429 736 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 STX6O43752 255 aa22.99■■□□□ 1.27
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ATG4D-208ENST00000588667 RGS20O76081 388 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 PGK1P00558 417 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 SYT1P21579 422 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 NFKBIBQ15653 356 aa22.99■■□□□ 1.27
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ATG4D-208ENST00000588667 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 RNF180Q86T96 592 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 TLK2Q86UE8 772 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 PGBD1Q96JS3 809 aa22.99■■□□□ 1.27
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ATG4D-208ENST00000588667 GBP4Q96PP9 640 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.99■■□□□ 1.27
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ATG4D-208ENST00000588667 Q9Y3F1 56 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 ADAMTS3O15072 1205 aa22.98■■□□□ 1.27
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ATG4D-208ENST00000588667 SREBF1P36956 1147 aa22.98■■□□□ 1.27
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ATG4D-208ENST00000588667 LRRC41Q15345 812 aa22.98■■□□□ 1.27
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ATG4D-208ENST00000588667 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.98■■□□□ 1.27
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ATG4D-208ENST00000588667 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.98■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 ARIH2O95376 493 aa22.97■■□□□ 1.27
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ATG4D-208ENST00000588667 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.97■■□□□ 1.27
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ATG4D-208ENST00000588667 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 KBTBD13C9JR72 458 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 NKX3-2P78367 333 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 BLIDQ8IZY5 108 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 TGFB3P10600 412 aa22.96■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.96■■□□□ 1.27
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