RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.2■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 VSTM4Q8IW00 320 aa23.2■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 ATP10DQ9P241 1426 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 GSTA1P08263 222 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 GSTA2P09210 222 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 CXCR5P32302 372 aa23.2■■□□□ 1.3
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PTPRM-211ENST00000580170 DISP1Q96F81 1524 aa23.2■■□□□ 1.3
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PTPRM-211ENST00000580170 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.2■■□□□ 1.3
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PTPRM-211ENST00000580170 CXorf38Q8TB03 319 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 THEGQ9P2T0 379 aa23.2■■□□□ 1.3
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PTPRM-211ENST00000580170 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 AMNQ9BXJ7 453 aa23.2■■□□□ 1.3
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM186BQ8IYM0 893 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 CDKL2Q92772 493 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF653Q96CK0 615 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa23.19■■□□□ 1.3
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PTPRM-211ENST00000580170 LRRC43Q8N309 656 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 DISC1Q9NRI5 854 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 COX16Q9P0S2 106 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 A6NJR5 290 aa23.19■■□□□ 1.3
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PTPRM-211ENST00000580170 TBCKQ8TEA7 893 aa23.19■■□□□ 1.3
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
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PTPRM-211ENST00000580170 TMOD1P28289 359 aa23.18■■□□□ 1.3
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PTPRM-211ENST00000580170 TCP11Q8WWU5 503 aa23.18■■□□□ 1.3
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PTPRM-211ENST00000580170 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
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PTPRM-211ENST00000580170 PRKAB2O43741 272 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 THAP9Q9H5L6 903 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 SEMA3EO15041 775 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 OATP04181 439 aa23.17■■□□□ 1.3
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PTPRM-211ENST00000580170 SGO2Q562F6 1265 aa23.17■■□□□ 1.3
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PTPRM-211ENST00000580170 ECE1P42892 770 aa23.17■■□□□ 1.3
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PTPRM-211ENST00000580170 TRIM11Q96F44 468 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 MAP7D3Q8IWC1 876 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 STK17AQ9UEE5 414 aa23.17■■□□□ 1.3
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PTPRM-211ENST00000580170 SLAIN2Q9P270 581 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 LRRN2O75325 713 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 TTLL1O95922 423 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 PAGE5Q96GU1 130 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 CNGA1P29973 690 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
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