RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-206ENST00000578093 MYO9BQ13459 2157 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 TRIM43BA6NCK2 446 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 C19orf81C9J6K1 198 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 ANP32CO43423 234 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 LDHCP07864 332 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 HOXC6P09630 235 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 ATP4AP20648 1035 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 BRD2P25440 801 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 CNGA1P29973 690 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 GUCY1A2P33402 732 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 ZAP70P43403 619 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 GSTO1P78417 241 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 SNX17Q15036 470 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 FOXR1Q6PIV2 292 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 FIGNL1Q6PIW4 674 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 NLRP8Q86W28 1048 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 CLEC10AQ8IUN9 316 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 MIGA1Q8NAN2 632 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 LPAR1Q92633 364 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 FERMT2Q96AC1 680 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 FEZ1Q99689 392 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 SEMA6BQ9H3T3 888 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 RUBCNLQ9H714 662 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 LRP2BPQ9P2M1 347 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 SEPT3Q9UH03 358 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 EGFL7Q9UHF1 273 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 LCTP09848 1927 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 PTPRSQ13332 1948 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 MYH4Q9Y623 1939 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 A0A1W2PNR3 127 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 A0A1W2PRG0 241 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 SLC15A5A6NIM6 579 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 SMIM22K7EJ46 135 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 FOSL2P15408 326 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 ADORA2AP29274 412 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 SHMT1P34896 483 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 ADCYAP1R1P41586 468 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 PLCD1P51178 756 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 GRIN2CQ14957 1233 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 RAB3GAP1Q15042 981 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 TNNI3KQ59H18 835 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 COX20Q5RI15 118 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 TTC39AQ5SRH9 613 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 GORABQ5T7V8 394 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 MFSD14CQ5VZR4 134 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 TATDN1Q6P1N9 297 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 LBX2Q6XYB7 198 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 TRIM22Q8IYM9 498 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 HELQQ8TDG4 1101 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 ANTXR1Q9H6X2 564 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 STIM2Q9P246 746 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 AKAP2Q9Y2D5 859 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 NCOR1O75376 2440 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 ROBO3Q96MS0 1386 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 WDFY4Q6ZS81 3184 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 SCN5AQ14524 2016 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 KBTBD13C9JR72 458 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 SEPT4O43236 478 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 MSCO60682 206 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 PPFIA3O75145 1194 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 FAM13AO94988 1023 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 BAG3O95817 575 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 HLA-DOAP06340 250 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 CYP2D6P10635 497 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 TRIM27P14373 513 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 ERCC3P19447 782 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 CYP7A1P22680 504 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 SCNN1AP37088 669 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 RARSP54136 660 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 ATP2B2Q01814 1243 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 TLE2Q04725 743 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-206ENST00000578093 SEPT2Q15019 361 aa4.81□□□□□ -1.64
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