RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568900.5

SPNS1-212, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2

Gene SPNS1, Length 2,253 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 WNK4Q96J92 1243 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 VWA5AO00534 786 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 MSH4O15457 936 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 HSD17B4P51659 736 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 MAP3K9P80192 1104 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 FANCCQ00597 558 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 RLFQ13129 1914 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 ECM1Q16610 540 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 KMT5BQ4FZB7 885 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 TMEM119Q4V9L6 283 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 TRIM9Q9C026 710 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 OTOFQ9HC10 1997 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 KLRC4O43908 158 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 EPHX2P34913 555 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 STX17P56962 302 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 AMPD3Q01432 767 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 MCM6Q14566 821 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 SV2BQ7L1I2 683 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 FAM20AQ96MK3 541 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 GDAQ9Y2T3 454 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 C7orf25Q9BPX7 421 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 WDR90Q96KV7 1748 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 ASIC1P78348 528 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 KCNB1Q14721 858 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 KCNK18Q7Z418 384 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 RAD54LQ92698 747 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 FDX1P10109 184 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 COL20A1Q9P218 1284 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 CSADQ9Y600 493 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 SERPINC1P01008 464 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 PTGS1P23219 599 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 RHOBTB3O94955 611 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 DSG3P32926 999 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 HYIQ5T013 277 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 POTEB3A0JP26 581 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 POTECB2RU33 542 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 TPM3P06753 285 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 COG2Q14746 738 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 SPATA1Q5VX52 437 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 POTEBQ6S5H4 581 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 CDCA5Q96FF9 252 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 PNMA2Q9UL42 364 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-212ENST00000568900 GLTPD2A6NH11 291 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 MYMKA6NI61 221 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 COBLO75128 1261 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF18P17022 549 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 PRCPP42785 496 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC144BQ3MJ40 725 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 CEP55Q53EZ4 464 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 EXOC1Q9NV70 894 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 VAV3Q9UKW4 847 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 PTPRFP10586 1907 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 MED24O75448 989 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 UBASH3AP57075 661 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 GHRHRQ02643 423 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 PDE4DQ08499 809 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 PAK1Q13153 545 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 DYMQ7RTS9 669 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-212ENST00000568900 REPS2Q8NFH8 660 aa23.38■■□□□ 1.33
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