RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 SLC9A7Q96T83 725 aa18.13■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 IL25Q9H293 177 aa18.13■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 JMJD4Q9H9V9 463 aa18.13■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 SORBS3O60504 671 aa18.12■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 NUCB1Q02818 461 aa18.12■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 FBXO11Q86XK2 927 aa18.12■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 HERC6Q8IVU3 1022 aa18.12■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 ARNTL2Q8WYA1 636 aa18.12■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 ANKS1AQ92625 1134 aa18.12■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 OSBPL3Q9H4L5 887 aa18.12■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 ZSWIM5Q9P217 1185 aa18.12■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 CFBP00751 764 aa18.11■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 ZNF286BP0CG31 522 aa18.11■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 STXBP2Q15833 593 aa18.11■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 CCDC178Q5BJE1 867 aa18.11■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 ARHGEF16Q5VV41 709 aa18.11■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 MCF2L2Q86YR7 1114 aa18.11■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 STAG2Q8N3U4 1231 aa18.11■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 IL27Q8NEV9 243 aa18.11■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 ALG1Q9BT22 464 aa18.11■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 BRWD1Q9NSI6 2320 aa18.11■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 OPLAHO14841 1288 aa18.1■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 TAP1Q03518 808 aa18.1■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 GPNMBQ14956 572 aa18.1■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 TCTN1Q2MV58 587 aa18.1■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 CCDC155Q8N6L0 562 aa18.1■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 EXOC6Q8TAG9 804 aa18.1■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 UBAC1Q9BSL1 405 aa18.1■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 DSCC1Q9BVC3 393 aa18.1■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 PXMP2Q9NR77 195 aa18.1■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa18.1■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 MTCH2Q9Y6C9 303 aa18.1■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 MRVI1Q9Y6F6 885 aa18.1■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 DOCK5Q9H7D0 1870 aa18.09■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 LCHNA4D1U4 455 aa18.09■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 CASTP20810 708 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 PSEN2P49810 448 aa18.09■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 KCNQ1P51787 676 aa18.09■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 LRRC8DQ7L1W4 858 aa18.09■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 AFAP1L1Q8TED9 768 aa18.09■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 IWS1Q96ST2 819 aa18.09■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 HDAC6Q9UBN7 1215 aa18.09■□□□□ 0.49
NME3-211ENST00000568561 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 NR3C2P08235 984 aa18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 SELPP16109 830 aa18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 KCNJ6P48051 423 aa18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 WDR5P61964 334 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 DEFB103AP81534 67 aa18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 DGKDQ16760 1214 aa18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 CYB5R4Q7L1T6 521 aa18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 SESTD1Q86VW0 696 aa18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 C7orf31Q8N865 590 aa18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 IL31RAQ8NI17 732 aa18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 CAGE1Q8TC20 777 aa18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 WNT8BQ93098 351 aa18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 AMNQ9BXJ7 453 aa18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 KRT23Q9C075 422 aa18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa18.08■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 HIP1O00291 1037 aa18.07■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 TLL1O43897 1013 aa18.07■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 NBNO60934 754 aa18.07■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 RGS20O76081 388 aa18.07■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 BAIAP3O94812 1187 aa18.07■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 COL9A1P20849 921 aa18.07■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 NT5C2P49902 561 aa18.07■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 HSD17B4P51659 736 aa18.07■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 MFSD10Q14728 455 aa18.07■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 KIAA0753Q2KHM9 967 aa18.07■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 HOMER1Q86YM7 354 aa18.07■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 CTNNA3Q9UI47 895 aa18.07■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 KIF28PB7ZC32 967 aa18.06■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 KLRF2D3W0D1 207 aa18.06■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 CKBP12277 381 aa18.06■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 BMP1P13497 986 aa18.06■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 GRB10Q13322 594 aa18.06■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 AAMPQ13685 434 aa18.06■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 HIC1Q14526 733 aa18.06■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 SEC23AQ15436 765 aa18.06■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 SLC35G1Q2M3R5 365 aa18.06■□□□□ 0.48
NME3-211ENST00000568561 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms