RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 LY6KQ17RY6 165 aa24.62■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 BRF1Q92994 677 aa24.62■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 CUL5Q93034 780 aa24.62■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.62■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 GRIN2DO15399 1336 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 GH1P01241 217 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 CDC27P30260 824 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 CCND2P30279 289 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 APOBRQ0VD83 1088 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 USP17L6PQ6QN14 398 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 TDHQ8IZJ6 230 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 BADQ92934 168 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 KPNA6O60684 536 aa24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 MYL3P08590 195 aa24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 ITGB8P26012 769 aa24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 PSMC6P62333 389 aa24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 ARHGAP1Q07960 439 aa24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 TBX21Q9UL17 535 aa24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.59■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 RUFY3Q7L099 469 aa24.59■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.59■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 TLR3O15455 904 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 CD4P01730 458 aa24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 RAG1P15918 1043 aa24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 AFG1LQ8WV93 481 aa24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-218ENST00000566180 STAM2O75886 525 aa24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 TGFB3P10600 412 aa24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 EVCP57679 992 aa24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 MMP3P08254 477 aa24.56■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 LAMC2Q13753 1193 aa24.56■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.56■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.56■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 NID2Q14112 1375 aa24.55■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.55■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 TIMP1P01033 207 aa24.55■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 LRIT3Q3SXY7 679 aa24.55■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.55■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 MYH6P13533 1939 aa24.55■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 ICAM3P32942 547 aa24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 SP2Q02086 613 aa24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 UBE2SQ16763 222 aa24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 GNPTABQ3T906 1256 aa24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 B4GALT4O60513 344 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 NAPAP54920 295 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 NBPF20Q3BBV1 942 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 PPTC7Q8NI37 304 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 BARHL2Q9NY43 387 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 STXBP3O00186 592 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 GGPS1O95749 300 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 DGKDQ16760 1214 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 MFSD5Q6N075 450 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 RIC8AQ9NPQ8 531 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-218ENST00000566180 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.51■■□□□ 1.51
RNPS1-218ENST00000566180 FIBPO43427 364 aa24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms