RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	ARHGAP1	Q07960	439 aa		29.37	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	GRIN2C	Q14957	1233 aa		29.37	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	RASIP1	Q5U651	963 aa		29.37	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		29.37	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	29.37	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		29.37	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	29.37	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		29.36	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	ANTXR2	P58335	489 aa		29.36	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	29.36	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	TROAP	Q12815	778 aa		29.36	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	29.36	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	29.36	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		29.36	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	29.36	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		29.36	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	RAB30	Q15771	203 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	PTGIS	Q16647	500 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	DGKD	Q16760	1214 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	MYL10	Q9BUA6	226 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	PRC1	O43663	620 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	LAMC2	Q13753	1193 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	29.34	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	29.34	■■■□□ 2.29	2e-10	■■■□□ 16.7
PPP4C-208	ENST00000564966	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	CYTH3	O43739	400 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	CCND2	P30279	289 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	BFSP2	Q13515	415 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	PGM5	Q15124	567 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	ALG1	Q9BT22	464 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC69	A6NI79	296 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	PFKM	P08237	780 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	KIF5B	P33176	963 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	MCM5	P33992	734 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	C7orf31	Q8N865	590 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	29.32	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	ACTN1	P12814	892 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	GHRHR	Q02643	423 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	IL31RA	Q8NI17	732 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	29.31	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	29.31	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	LY9	Q9HBG7	655 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	29.31	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	DDAH1	O94760	285 aa		29.3	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF286B	P0CG31	522 aa		29.3	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		29.3	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	SPATA33	Q96N06	139 aa		29.3	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		29.3	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	PITPNM1	O00562	1244 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC27A2	O14975	620 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	GGPS1	O95749	300 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	RFC2	P35250	354 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	PSEN2	P49810	448 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	RABGGTB	P53611	331 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	29.29	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	PPTC7	Q8NI37	304 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	KAT2B	Q92831	832 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	CUL5	Q93034	780 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	IQCF3	P0C7M6	154 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	TMTC2	Q8N394	836 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	29.28	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	RGS20	O76081	388 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	MFSD10	Q14728	455 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	SKAP1	Q86WV1	359 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	PPM1E	Q8WY54	764 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM87B	Q96K49	555 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	SCN5A	Q14524	2016 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4C-208	ENST00000564966	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	29.26	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	RXRA	P19793	462 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	GNAQ	P50148	359 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	29.26	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	MAP3K14	Q99558	947 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	MTA3	Q9BTC8	594 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	CDH23	Q9H251	3354 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A0C4DFX4	3053 aa		29.26	■■■□□ 2.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms