RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561280.5

CHP1-209, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 4

Gene CHP1, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-209	ENST00000561280	CRBN	Q96SW2	442 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CHP1-209	ENST00000561280	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	HIP1	O00291	1037 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	EFCAB14	O75071	495 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	KDM4A	O75164	1064 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	SDS	P20132	328 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	LAMC2	Q13753	1193 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	TET1	Q8NFU7	2136 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	CFB	P00751	764 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	KCNQ1	P51787	676 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	ARHGAP1	Q07960	439 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	AAMP	Q13685	434 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	IKBKE	Q14164	716 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	KRT23	Q9C075	422 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	CPVL	Q9H3G5	476 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	NEDD4	P46934	1319 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	NR3C2	P08235	984 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	PSEN2	P49810	448 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	TRAF1	Q13077	416 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	PTK7	Q13308	1070 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	GRB10	Q13322	594 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	PPTC7	Q8NI37	304 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	TBC1D5	Q92609	795 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	FAM122A	Q96E09	287 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	RAD9A	Q99638	391 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	AMN	Q9BXJ7	453 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	REV3L	O60673	3130 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	EPOP	A6NHQ4	379 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280		B4E1Z4	1266 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	CKB	P12277	381 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	MFSD10	Q14728	455 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	PXMP2	Q9NR77	195 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	PPFIA4	O75335	1185 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	CXCL10	P02778	98 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	RBL2	Q08999	1139 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	KRT40	Q6A162	431 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	KAT2B	Q92831	832 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	EMSY	Q7Z589	1322 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	GJB5	O95377	273 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	F2	P00734	622 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	COL20A1	Q9P218	1284 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	INSL6	Q9Y581	213 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	LAMA4	Q16363	1823 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHP1-209	ENST00000561280	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CHP1-209	ENST00000561280	NBN	O60934	754 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CHP1-209	ENST00000561280	ARHGEF15	O94989	841 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CHP1-209	ENST00000561280	AMH	P03971	560 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CHP1-209	ENST00000561280	TGFB3	P10600	412 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CHP1-209	ENST00000561280	PLA2G5	P39877	138 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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