RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554527.1

PAPLN-205, Transcript of papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene PAPLN, Length 784 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLN-205ENST00000554527 SEPT14Q6ZU15 432 aa16.04■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 TLK2Q86UE8 772 aa16.04■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 CCDC83Q8IWF9 413 aa16.04■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 ZMYND12Q9H0C1 365 aa16.04■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 TMEM260Q9NX78 707 aa16.04■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 SPDYE3A6NKU9 549 aa16.03■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 DNM1LO00429 736 aa16.03■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 JAK2O60674 1132 aa16.03■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 RGS20O76081 388 aa16.03■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 CLK2P49760 499 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 VSIG10LQ86VR7 867 aa16.03■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 CCDC148Q8NFR7 591 aa16.03■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 SCFD2Q8WU76 684 aa16.03■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 WDR11Q9BZH6 1224 aa16.03■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.03■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.03■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 KBTBD13C9JR72 458 aa16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 FDPSP14324 419 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 CAPN2P17655 700 aa16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 DUSP28Q4G0W2 176 aa16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 PCNX4Q63HM2 1172 aa16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 IQSEC1Q6DN90 963 aa16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 ARRDC4Q8NCT1 418 aa16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 RASGRP4Q8TDF6 673 aa16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 COPS5Q92905 334 aa16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 ANO3Q9BYT9 981 aa16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 GLT8D2Q9H1C3 349 aa16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 C6orf50Q9HD87 102 aa16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 SH3GLB2Q9NR46 395 aa16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PAPLN-205ENST00000554527 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 CTAGE5O15320 804 aa16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 TXNP10599 105 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 COL6A1P12109 1028 aa16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 GJA9P57773 515 aa16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 AP3B2Q13367 1082 aa16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 TTLL4Q14679 1199 aa16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 CCDC62Q6P9F0 684 aa16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 NECAB2Q7Z6G3 386 aa16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 RNF180Q86T96 592 aa16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 TEX2Q8IWB9 1127 aa16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 C11orf49Q9H6J7 331 aa16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 GJB4Q9NTQ9 266 aa16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 MRVI1Q9Y6F6 885 aa16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 CEP290O15078 2479 aa16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 LTBP2Q14767 1821 aa16.01■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 CST5P28325 142 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 GNA11P29992 359 aa16■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 NLRP5P59047 1200 aa16■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 BEX3Q00994 111 aa16■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 NPY5RQ15761 445 aa16■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 LY6KQ17RY6 165 aa16■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 KLHDC9Q8NEP7 349 aa16■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 EHMT1Q9H9B1 1298 aa16■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 RTEL1Q9NZ71 1219 aa16■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 KCNJ14Q9UNX9 436 aa16■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 KAT6AQ92794 2004 aa16■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 FOSP01100 380 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 FOSBP53539 338 aa15.99■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 SEMA3FQ13275 785 aa15.99■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 OR6J1Q8NGC5 347 aa15.99■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 FERMT2Q96AC1 680 aa15.99■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 ALG1Q9BT22 464 aa15.99■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.99■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 AP5M1Q9H0R1 490 aa15.99■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 SPC25Q9HBM1 224 aa15.99■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 PCDHA4Q9UN74 947 aa15.99■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 PHF24Q9UPV7 400 aa15.99■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 A0A1W2PQY0 241 aa15.98■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 SORBS3O60504 671 aa15.98■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 STAM2O75886 525 aa15.98■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 SREBF1P36956 1147 aa15.98■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 NKX3-2P78367 333 aa15.98■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 ARHGAP1Q07960 439 aa15.98■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 KCNA10Q16322 511 aa15.98■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 GNPTABQ3T906 1256 aa15.98■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 GNASQ5JWF2 1037 aa15.98■□□□□ 0.15
PAPLN-205ENST00000554527 XRRA1Q6P2D8 792 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms