RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 CCL23P55773 120 aa37.41■■■■□ 3.58
TTC7B-202ENST00000553948 PIBF1Q8WXW3 757 aa37.41■■■■□ 3.58
TTC7B-202ENST00000553948 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
TTC7B-202ENST00000553948 MRVI1Q9Y6F6 885 aa37.41■■■■□ 3.58
TTC7B-202ENST00000553948 MMP3P08254 477 aa37.4■■■■□ 3.58
TTC7B-202ENST00000553948 SLC17A8Q8NDX2 589 aa37.4■■■■□ 3.58
TTC7B-202ENST00000553948 SPZ1Q9BXG8 430 aa37.4■■■■□ 3.58
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC69A6NI79 296 aa37.39■■■■□ 3.58
TTC7B-202ENST00000553948 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
TTC7B-202ENST00000553948 WNT8AQ9H1J5 351 aa37.39■■■■□ 3.58
TTC7B-202ENST00000553948 CYP2C9P11712 490 aa37.38■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 PGM5Q15124 567 aa37.38■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 RASIP1Q5U651 963 aa37.38■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 FCHSD1Q86WN1 690 aa37.38■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 CHMP4BP1P59074 171 aa37.37■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 VSIG10LQ86VR7 867 aa37.37■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa37.37■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 LZTS2Q9BRK4 669 aa37.37■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP37.37■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 TMEM265A0A087WTH1 108 aa37.36■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 FGBP02675 491 aa37.36■■■■□ 3.57
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TTC7B-202ENST00000553948 SMARCA1P28370 1054 aa37.36■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 CCND2P30279 289 aa37.36■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 LIFRP42702 1097 aa37.36■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 GNAQP50148 359 aa37.36■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 RNF20Q5VTR2 975 aa37.36■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 LAMC2Q13753 1193 aa37.35■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 DGKDQ16760 1214 aa37.35■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 KCNV1Q6PIU1 500 aa37.35■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
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TTC7B-202ENST00000553948 HERVK_113Q902F9 699 aa37.35■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 RGS20O76081 388 aa37.34■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 CALM1P0DP23 149 aa37.34■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 CALM2P0DP24 149 aa37.34■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 CALM3P0DP25 149 aa37.34■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 DNAJB2P25686 324 aa37.34■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 SCLYQ96I15 445 aa37.33■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 MYH7BA7E2Y1 1941 aa37.32■■■■□ 3.57
TTC7B-202ENST00000553948 PPTC7Q8NI37 304 aa37.32■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 NOD1Q9Y239 953 aa37.32■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 SLC12A7Q9Y666 1083 aa37.32■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 CDC45O75419 566 aa37.31■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 PLEKHA8P1O95397 391 aa37.31■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 KAT2BQ92831 832 aa37.31■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 LRRC2Q9BYS8 371 aa37.31■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 TGFB3P10600 412 aa37.3■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 RXRAP19793 462 aa37.3■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 OTOP2Q7RTS6 562 aa37.3■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
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TTC7B-202ENST00000553948 SESTD1Q86VW0 696 aa37.29■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 TIFAQ96CG3 184 aa37.29■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 PITPNM1O00562 1244 aa37.28■■■■□ 3.56
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TTC7B-202ENST00000553948 MYSM1Q5VVJ2 828 aa37.28■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 RETREG2Q8NC44 543 aa37.28■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 CUL5Q93034 780 aa37.28■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 FRMPD4Q14CM0 1322 aa37.28■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 GGPS1O95749 300 aa37.27■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 PFKMP08237 780 aa37.27■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 BFSP2Q13515 415 aa37.27■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 PTGISQ16647 500 aa37.27■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 SGMS1Q86VZ5 419 aa37.27■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa37.27■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa37.27■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 MYLIPQ8WY64 445 aa37.27■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 SPATA33Q96N06 139 aa37.27■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 NEK1Q96PY6 1258 aa37.27■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 KATNAL1Q9BW62 490 aa37.27■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 PBX4Q9BYU1 374 aa37.27■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 VWCEQ96DN2 955 aa37.26■■■■□ 3.56
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC136Q96JN2 1154 aa37.26■■■■□ 3.56
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TTC7B-202ENST00000553948 STAM2O75886 525 aa37.25■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF286BP0CG31 522 aa37.25■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 RFC2P35250 354 aa37.25■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 PBX2P40425 430 aa37.25■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 PSEN2P49810 448 aa37.25■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 SP2Q02086 613 aa37.25■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 GNPTABQ3T906 1256 aa37.25■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa37.25■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 DEFB128Q7Z7B8 93 aa37.25■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 C7orf31Q8N865 590 aa37.25■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 FANCBQ8NB91 859 aa37.25■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF576Q9H609 170 aa37.25■■■■□ 3.55
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