RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545964.1

MDM1-215, Transcript of Mdm1 nuclear protein, human

TSL 2

Gene MDM1, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM1-215	ENST00000545964	GDF15	Q99988	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	GPR108	Q9NPR9	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	GINM1	Q9NU53	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	FLT1	P17948	1338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964		A0A1W2PPC1	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	CCER2	I3L3R5	266 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	FST	P19883	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	CYP2C19	P33261	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	BMP8B	P34820	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	PLCD1	P51178	756 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	MAP3K12	Q12852	859 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	NCOA4	Q13772	614 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	PLS1	Q14651	629 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	PCSK7	Q16549	785 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	EML3	Q32P44	896 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	AACS	Q86V21	672 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	USP6NL	Q92738	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	CNMD	O75829	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	RLBP1	P12271	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	USP14	P54578	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	COG2	Q14746	738 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	SEPT2	Q15019	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	PANK1	Q8TE04	598 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	FAM161B	Q96MY7	647 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	UCN2	Q96RP3	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	NOD1	Q9Y239	953 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	PFAS	O15067	1338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	BRCA2	P51587	3418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964		A0A1W2PRG0	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	GOLIM4	O00461	696 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	CYP2D6	P10635	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	COL6A1	P12109	1028 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	VCAM1	P19320	739 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	SHMT1	P34896	483 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	SPEM2	Q0P670	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	FERMT2	Q96AC1	680 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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