RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, human

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STIP1-208	ENST00000540501	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		29.23	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	MAFG	O15525	162 aa		29.22	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	LETM2	Q2VYF4	491 aa		29.22	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		29.22	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		29.22	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	RAET1E	Q8TD07	263 aa		29.22	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	TRIM17	Q9Y577	477 aa		29.22	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		29.21	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	CYP3A7	P24462	503 aa		29.21	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	ARMCX2	Q7L311	632 aa		29.21	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		29.21	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	NLRX1	Q86UT6	975 aa		29.21	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		29.21	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	CDHR1	Q96JP9	859 aa		29.21	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	MCM3AP	O60318	1980 aa		29.21	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	ASTN1	O14525	1302 aa		29.2	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		29.2	■■■□□ 2.27
STIP1-208	ENST00000540501	BMP15	O95972	392 aa		29.2	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	UBXN2A	P68543	259 aa		29.2	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	CEP55	Q53EZ4	464 aa		29.2	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	TTC38	Q5R3I4	469 aa		29.2	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		29.2	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		29.2	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	VTA1	Q9NP79	307 aa		29.2	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		29.2	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		29.2	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	FAM205C	A6NFA0	338 aa		29.19	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		29.19	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		29.19	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		29.19	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	CAP1	Q01518	475 aa		29.18	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501		Q4G0T1	1027 aa		29.18	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	IL31RA	Q8NI17	732 aa		29.18	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	GPRASP2	Q96D09	838 aa		29.18	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	MBOAT7	Q96N66	472 aa		29.18	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	CFAP45	Q9UL16	551 aa		29.18	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		29.18	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		29.18	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	ATP2B1	P20020	1258 aa		29.17	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	LBX1	P52954	281 aa		29.17	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		29.17	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	JADE2	Q9NQC1	790 aa		29.17	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	MEIS1	O00470	390 aa		29.16	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	ADCY3	O60266	1144 aa		29.16	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	IGHA2	P01877	340 aa		29.16	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		29.16	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	LAD1	O00515	517 aa		29.15	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	TGFB3	P10600	412 aa		29.15	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	ICAM3	P32942	547 aa		29.15	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		29.15	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		29.14	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	TBX3	O15119	743 aa		29.14	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	FIBP	O43427	364 aa		29.14	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	EDIL3	O43854	480 aa		29.14	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	HMGCR	P04035	888 aa		29.14	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	KRT85	P78386	507 aa		29.14	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		29.14	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		29.14	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		29.14	■■■□□ 2.26
STIP1-208	ENST00000540501	FAM86B1	E9PN63	330 aa		29.13	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	NEMF	O60524	1076 aa		29.13	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	TDP2	O95551	362 aa		29.13	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		29.13	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	MCM7	P33993	719 aa		29.13	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	MTMR1	Q13613	665 aa		29.13	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	ZNF174	Q15697	407 aa		29.13	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	CCL14	Q16627	93 aa		29.13	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	PRR16	Q569H4	304 aa		29.13	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	ANO1	Q5XXA6	986 aa		29.13	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	SCFD2	Q8WU76	684 aa		29.13	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	TRIB2	Q92519	343 aa		29.13	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		29.13	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		29.13	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		29.12	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	ITGB5	P18084	799 aa		29.12	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	ACVR2B	Q13705	512 aa		29.12	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		29.12	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	FAM20A	Q96MK3	541 aa		29.12	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	MARCH6	O60337	910 aa		29.11	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	GRK4	P32298	578 aa		29.11	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	TTLL4	Q14679	1199 aa		29.11	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		29.11	■■■□□ 2.25
STIP1-208	ENST00000540501	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms