RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531129.5

GPATCH4-215, Transcript of G-patch domain containing 4, human

TSL 5

Gene GPATCH4, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPATCH4-215	ENST00000531129	ABCB11	O95342	1321 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GPATCH4-215	ENST00000531129	TTC28	Q96AY4	2481 aa		13.58	□□□□□ -0.23
GPATCH4-215	ENST00000531129	STXBP2	Q15833	593 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	FBXO11	Q86XK2	927 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	LCHN	A4D1U4	455 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	OPLAH	O14841	1288 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	SORBS3	O60504	671 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	CFB	P00751	764 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	NR3C2	P08235	984 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	IL27	Q8NEV9	243 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	IL25	Q9H293	177 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	TLL1	O43897	1013 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	NBN	O60934	754 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	RGS20	O76081	388 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	SELP	P16109	830 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	PSEN2	P49810	448 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	DEFB103A	P81534	67 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	NUCB1	Q02818	461 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	GRB10	Q13322	594 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	HIC1	Q14526	733 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	TET1	Q8NFU7	2136 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	WNT8B	Q93098	351 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	PXMP2	Q9NR77	195 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	TRANK1	O15050	2925 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	PTPRS	Q13332	1948 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	LPXN	O60711	386 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	BAIAP3	O94812	1187 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	CKB	P12277	381 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	KCNJ6	P48051	423 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	DGKD	Q16760	1214 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	HAS3	O00219	553 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	HSD17B4	P51659	736 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	SP2	Q02086	613 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	LAMC2	Q13753	1193 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	MFSD10	Q14728	455 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	SEC23A	Q15436	765 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	IL31RA	Q8NI17	732 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	AMN	Q9BXJ7	453 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	KRT23	Q9C075	422 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	MAF1	Q9H063	256 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	LAMA4	Q16363	1823 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GPATCH4-215	ENST00000531129	CXCL10	P02778	98 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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