RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525809.5

BBS1-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5

Gene BBS1, Length 601 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-208	ENST00000525809	USP38	Q8NB14	1042 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	CAGE1	Q8TC20	777 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PPM1E	Q8WY54	764 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	KAT2B	Q92831	832 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	IL25	Q9H293	177 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PPFIA4	O75335	1185 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	CYP21A2	P08686	494 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	POLR2M	P0CAP2	368 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	TGFB3	P10600	412 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PTH1R	Q03431	593 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	ADGRE1	Q14246	886 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	GRM4	Q14833	912 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	WTAP	Q15007	396 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	C7orf31	Q8N865	590 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	NCOA7	Q8NI08	942 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	OPLAH	O14841	1288 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	MYOG	P15173	224 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PSEN2	P49810	448 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PPTC7	Q8NI37	304 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PIGS	Q96S52	555 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	SLC9A7	Q96T83	725 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809		E7EWF7	191 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	SGSM2	O43147	1006 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	BAIAP3	O94812	1187 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	SELP	P16109	830 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	CCND2	P30279	289 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	TROAP	Q12815	778 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	MFSD10	Q14728	455 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	HOMER1	Q86YM7	354 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	MAP4K1	Q92918	833 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	ALG1	Q9BT22	464 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	COL6A3	P12111	3177 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	HAS3	O00219	553 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	RGS20	O76081	388 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	KCNJ6	P48051	423 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	RBL2	Q08999	1139 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	PTK7	Q13308	1070 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	PGM5	Q15124	567 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	TMTC2	Q8N394	836 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	SPATA33	Q96N06	139 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	MAP3K14	Q99558	947 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	MTA3	Q9BTC8	594 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	SENP2	Q9HC62	589 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	THEG	Q9P2T0	379 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	CYTH3	O43739	400 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	STAM2	O75886	525 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	GGPS1	O95749	300 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	F2	P00734	622 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	CXCL10	P02778	98 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	CA3	P07451	260 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	CKB	P12277	381 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	SMARCA1	P28370	1054 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	GNAQ	P50148	359 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	GPNMB	Q14956	572 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	ASB2	Q96Q27	587 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-208	ENST00000525809	MCM3AP	O60318	1980 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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