RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520389.5

ITGB2-216, Transcript of integrin subunit beta 2, humanhuman

TSL 5

Gene ITGB2, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2-216ENST00000520389 CCT2P78371 535 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 KCNA10Q16322 511 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 TRIM60Q495X7 471 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 DUSP28Q4G0W2 176 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 TMEM63BQ5T3F8 832 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 USP17L6PQ6QN14 398 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 VSIG10LQ86VR7 867 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 PDCD2LQ9BRP1 358 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 AP5M1Q9H0R1 490 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 PHF24Q9UPV7 400 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 CST5P28325 142 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 EPHB4P54760 987 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 NTRK3Q16288 839 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 GNASQ5JWF2 1037 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 WWC2Q6AWC2 1192 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 SCFD2Q8WU76 684 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 MYLIPQ8WY64 445 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 CUL5Q93034 780 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 FERMT2Q96AC1 680 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 NID2Q14112 1375 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 TTC28Q96AY4 2481 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 MYADML2A6NDP7 307 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 MOXD2PA6NHM9 499 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 hCG_1984214I3L0E3 225 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 CTAGE5O15320 804 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 TXNP10599 105 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 IFNAR1P17181 557 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 PGM5Q15124 567 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 TLK2Q86UE8 772 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 PTGS1P23219 599 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 ACLYP53396 1101 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 NAPAP54920 295 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 TTLL4Q14679 1199 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 ANKRD1Q15327 319 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 PKN1Q16512 942 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 C1orf53Q5VUE5 145 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 TYW1BQ6NUM6 668 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 CCDC62Q6P9F0 684 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 SEPT14Q6ZU15 432 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 PHKBQ93100 1093 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 BARHL2Q9NY43 387 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 STXBP3O00186 592 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 ASGR1P07306 291 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 SCG2P13521 617 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 CCND2P30279 289 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 NEK4P51957 841 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 BEX3Q00994 111 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 TLE2Q04725 743 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 PPP1R18Q6NYC8 613 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 TEX2Q8IWB9 1127 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 IL31RAQ8NI17 732 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 MUC3AQ02505 3323 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 FRMPD4Q14CM0 1322 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 A0A1W2PQY0 241 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 SMCO2A6NFE2 343 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 CPLX1O14810 134 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 ZEB2O60315 1214 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 PPFIA3O75145 1194 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 RGS20O76081 388 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 ARIH2O95376 493 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 AK2P54819 239 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 STK3Q13188 491 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 LY6KQ17RY6 165 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 XRRA1Q6P2D8 792 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 COPS5Q92905 334 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 RIC8AQ9NPQ8 531 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 ELP1O95163 1332 aa16.02■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 TGFB3P10600 412 aa16.02■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 UBE2SQ16763 222 aa16.02■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 KCNV1Q6PIU1 500 aa16.02■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 USP38Q8NB14 1042 aa16.02■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 OR6J1Q8NGC5 347 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms