RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504431.1

UBE2B-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-204ENST00000504431 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
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UBE2B-204ENST00000504431 SLITRK5O94991 958 aa9.56□□□□□ -0.88
UBE2B-204ENST00000504431 MYL6BP14649 208 aa9.56□□□□□ -0.88
UBE2B-204ENST00000504431 RFC4P35249 363 aa9.56□□□□□ -0.88
UBE2B-204ENST00000504431 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.56□□□□□ -0.88
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UBE2B-204ENST00000504431 MTFR1LQ9H019 292 aa9.56□□□□□ -0.88
UBE2B-204ENST00000504431 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
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UBE2B-204ENST00000504431 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
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UBE2B-204ENST00000504431 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.55□□□□□ -0.88
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UBE2B-204ENST00000504431 CASP7P55210 303 aa9.54□□□□□ -0.88
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UBE2B-204ENST00000504431 DNAJB8Q8NHS0 232 aa9.54□□□□□ -0.88
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UBE2B-204ENST00000504431 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.54□□□□□ -0.88
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UBE2B-204ENST00000504431 COL15A1P39059 1388 aa9.53□□□□□ -0.88
UBE2B-204ENST00000504431 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
UBE2B-204ENST00000504431 EOMESO95936 686 aa9.53□□□□□ -0.88
UBE2B-204ENST00000504431 GYS1P13807 737 aa9.53□□□□□ -0.88
UBE2B-204ENST00000504431 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
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UBE2B-204ENST00000504431 SFRP5Q5T4F7 317 aa9.53□□□□□ -0.88
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UBE2B-204ENST00000504431 RNF141Q8WVD5 230 aa9.53□□□□□ -0.88
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UBE2B-204ENST00000504431 UBXN4Q92575 508 aa9.52□□□□□ -0.89
UBE2B-204ENST00000504431 SLC9A7Q96T83 725 aa9.52□□□□□ -0.89
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UBE2B-204ENST00000504431 DDR1Q08345 913 aa9.51□□□□□ -0.89
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UBE2B-204ENST00000504431 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.51□□□□□ -0.89
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UBE2B-204ENST00000504431 WDR63Q8IWG1 891 aa9.51□□□□□ -0.89
UBE2B-204ENST00000504431 LRP5O75197 1615 aa9.5□□□□□ -0.89
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UBE2B-204ENST00000504431 CAMTA2O94983 1202 aa9.5□□□□□ -0.89
UBE2B-204ENST00000504431 ACRP10323 421 aa9.5□□□□□ -0.89
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UBE2B-204ENST00000504431 ZNF521Q96K83 1311 aa9.5□□□□□ -0.89
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UBE2B-204ENST00000504431 A0A1W2PQH9 124 aa9.49□□□□□ -0.89
UBE2B-204ENST00000504431 CYP26A1O43174 497 aa9.49□□□□□ -0.89
UBE2B-204ENST00000504431 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
UBE2B-204ENST00000504431 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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