RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 GHRHRQ02643 423 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 AP3B2Q13367 1082 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 ACVR2BQ13705 512 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 SEPT14Q6ZU15 432 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 BLIDQ8IZY5 108 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 IWS1Q96ST2 819 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 PDCD2LQ9BRP1 358 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 ANO3Q9BYT9 981 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 RPTORQ8N122 1335 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 H3BQV1 296 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 KRT2P35908 639 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF76P36508 570 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 BECN1Q14457 450 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 PGM5Q15124 567 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 ANO1Q5XXA6 986 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 MCTP2Q6DN12 878 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 GALNT17Q6IS24 598 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 IL31RAQ8NI17 732 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 DEFB118Q96PH6 123 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 VTA1Q9NP79 307 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 CYBAP13498 195 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC144BQ3MJ40 725 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 KRT40Q6A162 431 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 TRPV1Q8NER1 839 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 RTEL1Q9NZ71 1219 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 NRBP1Q9UHY1 535 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM184BQ9ULE4 1060 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 LCTP09848 1927 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 ADAMTS3O15072 1205 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 RARBP10826 455 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 AKR1A1P14550 325 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 ADCYAP1R1P41586 468 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 CUL4AQ13619 759 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 GNPTABQ3T906 1256 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 MCTP1Q6DN14 999 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 KRT25Q7Z3Z0 450 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 TEX2Q8IWB9 1127 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 PDGFCQ9NRA1 345 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 SEPT4O43236 478 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 TFRCP02786 760 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 MMP1P03956 469 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 EDNRBP24530 442 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGAP4P98171 946 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 TNFAIP2Q03169 654 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 PCNX4Q63HM2 1172 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 DAGLBQ8NCG7 672 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 OXER1Q8TDS5 423 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 SCFD2Q8WU76 684 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 WDR11Q9BZH6 1224 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 MRVI1Q9Y6F6 885 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-204ENST00000503638 MCM3APO60318 1980 aa15.27■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 SORBS3O60504 671 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 MSCO60682 206 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 TXNP10599 105 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 SREBF1P36956 1147 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 CLK2P49760 499 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 NR5A1Q13285 461 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 TTLL4Q14679 1199 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 XRRA1Q6P2D8 792 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 NLRX1Q86UT6 975 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 VSIG10LQ86VR7 867 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 MORC4Q8TE76 937 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 PKD2L1Q9P0L9 805 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 FRMPD4Q14CM0 1322 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 BTBD18B2RXH4 712 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 STAM2O75886 525 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 PDCP20941 246 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 INF2Q27J81 1249 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 TBCKQ8TEA7 893 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 AP5M1Q9H0R1 490 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 SPC25Q9HBM1 224 aa15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms