RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-208ENST00000494664 KCND1Q9NSA2 647 aa13.39□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCTP09848 1927 aa13.39□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 CFBP00751 764 aa13.39□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 MMP1P03956 469 aa13.39□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 NR5A1Q13285 461 aa13.39□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 ELF2Q15723 593 aa13.39□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 PPP1R18Q6NYC8 613 aa13.39□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 ACAD9Q9H845 621 aa13.39□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 PSTPIP2Q9H939 334 aa13.39□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 WBP1LQ9NX94 342 aa13.39□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 COL20A1Q9P218 1284 aa13.39□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 NLRP5P59047 1200 aa13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 RPS6P62753 249 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 NSMFQ6X4W1 530 aa13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 RIC8AQ9NPQ8 531 aa13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMEM260Q9NX78 707 aa13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 PLXNB2O15031 1838 aa13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 ESYT2A0FGR8 921 aa13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 BTBD18B2RXH4 712 aa13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 KIF28PB7ZC32 967 aa13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 SKILP12757 684 aa13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 ADCY7P51828 1080 aa13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC144BQ3MJ40 725 aa13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 TEX35Q5T0J7 233 aa13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC148Q8NFR7 591 aa13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 PGBD1Q96JS3 809 aa13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPATA32Q96LK8 384 aa13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 DNAH12Q6ZR08 3092 aa13.38□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 FAM205CA6NFA0 338 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 M0R2N6 131 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC25A27O95847 323 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 TUBB4AP04350 444 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 PGK2P07205 417 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCNA1P78396 465 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 GPR142Q7Z601 462 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 SHCBP1Q8NEM2 672 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 CHST13Q8NET6 341 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 CUL5Q93034 780 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 MROH8Q9H579 483 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 SAGE1Q9NXZ1 904 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 CYP39A1Q9NYL5 469 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 PCDHA4Q9UN74 947 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 ASTN1O14525 1302 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 H3BQV1 296 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 XBP1P17861 261 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 HSD17B4P51659 736 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRIM29Q14134 588 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 TKFCQ3LXA3 575 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 IFFO2Q5TF58 517 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 FERMT3Q86UX7 667 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 DNAJC25Q9H1X3 360 aa13.37□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 MGAMO43451 1857 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 GPR25O00155 361 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 CALML3P27482 149 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 CLK2P49760 499 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 CNTN2Q02246 1040 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 GHRHRQ02643 423 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRAF1Q13077 416 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 RNF207Q6ZRF8 634 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 BLIDQ8IZY5 108 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 ANKRD35Q8N283 1001 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 TNFRSF25Q93038 417 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRIM47Q96LD4 638 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 C6orf50Q9HD87 102 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 PNMA2Q9UL42 364 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 V9GYY5 206 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 PIK3CDO00329 1044 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 SP3Q02447 781 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 JMYQ8N9B5 988 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 DAGLBQ8NCG7 672 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 FBXO40Q9UH90 709 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 PCDHA6Q9UN73 950 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa13.36□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 POLR2MP0CAP2 368 aa13.35□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 CAPN2P17655 700 aa13.35□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 ADORA2AP29274 412 aa13.35□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 GNA11P29992 359 aa13.35□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 MAPK4P31152 587 aa13.35□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRT2P35908 639 aa13.35□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 GSDMDP57764 484 aa13.35□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 TPM4P67936 248 aa13.35□□□□□ -0.27
TIMMDC1-208ENST00000494664 FCHSD1Q86WN1 690 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms