RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CSRNP1	Q96S65	589 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM196B	A6NMK8	535 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	USP17L5	A8MUK1	530 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	BECN2	A8MW95	431 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	COBL	O75128	1261 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	UQCRH	P07919	91 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	AKR1B1	P15121	316 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF18	P17022	549 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	NLRP5	P59047	1200 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	FKBP1B	P68106	108 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PTGDR	Q13258	359 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	POSTN	Q15063	836 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	DCAF15	Q66K64	600 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	RGMB	Q6NW40	437 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TMC6	Q7Z403	805 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CERS3	Q8IU89	383 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	BLID	Q8IZY5	108 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	STAM	Q92783	540 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	DHX58	Q96C10	678 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	KLRG1	Q96E93	195 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	HOOK2	Q96ED9	719 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PAGE5	Q96GU1	130 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	KAT14	Q9H8E8	782 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	FANCL	Q9NW38	375 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	MTMR7	Q9Y216	660 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	MYH4	Q9Y623	1939 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PSME4	Q14997	1843 aa		6.6	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PP2D1	A8MPX8	630 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	AOC2	O75106	756 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	HLA-DOA	P06340	250 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CDC25A	P30304	524 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	INPP5B	P32019	993 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	MCM7	P33993	719 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	AFM	P43652	599 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CUL4B	Q13620	913 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM139	Q8IV31	216 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC102A	Q96A19	550 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CEP95	Q96GE4	821 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	WRNIP1	Q96S55	665 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	ELP3	Q9H9T3	547 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		6.59	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	RASSF10	A6NK89	507 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SMTNL1	A8MU46	457 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	KLRF2	D3W0D1	207 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	FANCG	O15287	622 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SMC2	O95347	1197 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SLFN14	P0C7P3	912 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TSPY3	P0CV98	308 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TSPY8	P0CW00	308 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SHMT1	P34896	483 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ECE1	P42892	770 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	JAG1	P78504	1218 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	MYL5	Q02045	173 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP3K10	Q02779	954 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	VGLL4	Q14135	290 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	INF2	Q27J81	1249 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		6.58	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	VSTM4	Q8IW00	320 aa		6.58	□□□□□ -1.36

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