RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 BICDL2A1A5D9 508 aa14.33□□□□□ -0.11
PRAME-213ENST00000492657 NDUFA10O95299 355 aa14.33□□□□□ -0.11
PRAME-213ENST00000492657 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.33□□□□□ -0.11
PRAME-213ENST00000492657 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.11
PRAME-213ENST00000492657 PDIA5Q14554 519 aa14.33□□□□□ -0.11
PRAME-213ENST00000492657 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.33□□□□□ -0.11
PRAME-213ENST00000492657 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.11
PRAME-213ENST00000492657 DDX12PQ92771 950 aa14.33□□□□□ -0.11
PRAME-213ENST00000492657 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.11
PRAME-213ENST00000492657 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.11
PRAME-213ENST00000492657 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.11
PRAME-213ENST00000492657 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.33□□□□□ -0.11
PRAME-213ENST00000492657 SLX4Q8IY92 1834 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 AOC3Q16853 763 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 UNC13DQ70J99 1090 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 DNAJC7Q99615 494 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 EHD4Q9H223 541 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 STK17AQ9UEE5 414 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 CENPPQ6IPU0 288 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 CCDC17Q96LX7 622 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 SIPA1L1O43166 1804 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 PLSCR1O15162 318 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 STAT3P40763 770 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 E9PMD0 336 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.32□□□□□ -0.121e-10■■■□□ 15.8
PRAME-213ENST00000492657 HERVK_113P62684 666 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 SEMA3FQ13275 785 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 RAB34Q9BZG1 259 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 H0YIN7 160 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 EPHB6O15197 1021 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 F5H6K3 240 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 ICA1Q05084 483 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 KLRC3Q07444 240 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 USH1GQ495M9 461 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 MKL1Q969V6 931 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 CDC23Q9UJX2 597 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 CTAGE9A4FU28 777 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 RCCD1A6NED2 376 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 IDI2Q9BXS1 227 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 ANO3Q9BYT9 981 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 NYAP2Q9P242 653 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 POTEB3A0JP26 581 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 POTECB2RU33 542 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD65E5RJM6 399 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 TULP2O00295 520 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 MEIS2O14770 477 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 OAS2P29728 719 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 CYP27A1Q02318 531 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 POTEBQ6S5H4 581 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 ENC1O14682 589 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 NDUFB10O96000 172 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 GH2P01242 217 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 CHMP4BP1P59074 171 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 EHHADHQ08426 723 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 COASYQ13057 564 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-213ENST00000492657 DCAF4Q8WV16 495 aa14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms