RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 STAT3P40763 770 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL20-204ENST00000489160 SNX17Q15036 470 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL20-204ENST00000489160 MCTP1Q6DN14 999 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL20-204ENST00000489160 CEP68Q76N32 757 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL20-204ENST00000489160 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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CCL20-204ENST00000489160 LZTR1Q8N653 840 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL20-204ENST00000489160 NUP43Q8NFH3 380 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL20-204ENST00000489160 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL20-204ENST00000489160 MTA3Q9BTC8 594 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL20-204ENST00000489160 CDIP1Q9H305 208 aa7.03□□□□□ -1.28
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CCL20-204ENST00000489160 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL20-204ENST00000489160 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL20-204ENST00000489160 C22orf46C9J442 243 aa7.02□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 GSTA4O15217 222 aa7.02□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
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CCL20-204ENST00000489160 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.02□□□□□ -1.29
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CCL20-204ENST00000489160 FAM83GA6ND36 823 aa7.01□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 PAPLNO95428 1278 aa7.01□□□□□ -1.29
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CCL20-204ENST00000489160 CFAP100Q494V2 611 aa7.01□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
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CCL20-204ENST00000489160 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7.01□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 RNF180Q86T96 592 aa7.01□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 NLRX1Q86UT6 975 aa7.01□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 ANKLE2Q86XL3 938 aa7.01□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.01□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.01□□□□□ -1.29
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CCL20-204ENST00000489160 CYP4F8P98187 520 aa7□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 TIGD5Q53EQ6 642 aa7□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 C16orf59Q7L2K0 433 aa7□□□□□ -1.29
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CCL20-204ENST00000489160 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7□□□□□ -1.29
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CCL20-204ENST00000489160 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
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CCL20-204ENST00000489160 KCNJ15Q99712 375 aa6.99□□□□□ -1.29
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CCL20-204ENST00000489160 PYGMP11217 842 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 GNAT1P11488 350 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 DNM2P50570 870 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-204ENST00000489160 AMPD3Q01432 767 aa6.98□□□□□ -1.29
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