RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 ACAD9Q9H845 621 aa7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 CCPG1Q9ULG6 757 aa7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 MYO9BQ13459 2157 aa7.22□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 B4E1Z4 1266 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ZNF213O14771 459 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 KDM4AO75164 1064 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 FGRP09769 529 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TOP1P11387 765 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 AKR1A1P14550 325 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 UBE2HP62256 183 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 BEX3Q00994 111 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ACVR2BQ13705 512 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ME3Q16798 604 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 CCDC144BQ3MJ40 725 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TMEM63BQ5T3F8 832 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 Q7L0L9 218 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ARMCX2Q7L311 632 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 FBXL16Q8N461 479 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 CHST13Q8NET6 341 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 FBXO40Q9UH90 709 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 FAM184BQ9ULE4 1060 aa7.21□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 A0A0C4DFX4 3053 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 A0A1W2PQY0 241 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 NFIBO00712 420 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ASTN1O14525 1302 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ZMYM6O95789 1325 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 BMP8BP34820 402 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 OAZ1P54368 228 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 FGD1P98174 961 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TLE2Q04725 743 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 KCNA10Q16322 511 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 RNF180Q86T96 592 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 FAM133AQ8N9E0 248 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 GPT2Q8TD30 523 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 BADQ92934 168 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 PDGFCQ9NRA1 345 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 PHF24Q9UPV7 400 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 CDH23Q9H251 3354 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 WDR19Q8NEZ3 1342 aa7.2□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 PTPDC1A2A3K4 754 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TRIM43BA6NCK2 446 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 RCCD1A6NED2 376 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 GPR37O15354 613 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 PLA2G6O60733 806 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ADAMTS4O75173 837 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 CYP21A2P08686 494 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 PDHBP11177 359 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ITGB8P26012 769 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 CALML3P27482 149 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 NOVP48745 357 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ACLYP53396 1101 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 KRT85P78386 507 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 KCNC4Q03721 635 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 HIC1Q14526 733 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 USH1GQ495M9 461 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 SLC30A10Q6XR72 485 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TDHQ8IZJ6 230 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 FAM184AQ8NB25 1140 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 RGS22Q8NE09 1264 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 ESR2Q92731 530 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 GTF3C6Q969F1 213 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 AGXT2Q9BYV1 514 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 KATNBL1Q9H079 304 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 VAT1LQ9HCJ6 419 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 PDLIM7Q9NR12 457 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 CYP39A1Q9NYL5 469 aa7.19□□□□□ -1.26
MITF-215ENST00000478490 NRBP1Q9UHY1 535 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms