RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 TBCKQ8TEA7 893 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 B4DLN1 442 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 PKP1Q13835 747 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 STXBP2Q15833 593 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 VTA1Q9NP79 307 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 STAM2O75886 525 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 ITGB5P18084 799 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 CIITAP33076 1130 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 INF2Q27J81 1249 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 ARMC5Q96C12 935 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 USP11P51784 963 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 ACVR2BQ13705 512 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 FAM86B1E9PN63 330 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 WNT7AO00755 349 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 RESTQ13127 1097 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 SEMA3FQ13275 785 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 MCTP1Q6DN14 999 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 MBOAT7Q96N66 472 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 CYP3A7P24462 503 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 CEP55Q53EZ4 464 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 NEK8Q86SG6 692 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 FERMT3Q86UX7 667 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 LENG9Q96B70 501 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 ZNF333Q96JL9 665 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-210ENST00000477812 MEIS1O00470 390 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 ADCY6O43306 1168 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 TDP2O95551 362 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 ICAM3P32942 547 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 JADE2Q9NQC1 790 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 ARIH2O95376 493 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 BRAPQ7Z569 592 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 SCFD2Q8WU76 684 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 GPRASP2Q96D09 838 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 BRD1O95696 1058 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 TRAPPC10P48553 1259 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 LETM2Q2VYF4 491 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 GNPTABQ3T906 1256 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 BRCA2P51587 3418 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 SEPT4O43236 478 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 FIBPO43427 364 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 MTMR1Q13613 665 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 MTFR1Q15390 333 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 Q4G0T1 1027 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 SLC37A4O43826 429 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 ARP10275 920 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-210ENST00000477812 SMPD1P17405 629 aa22.66■■□□□ 1.22
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