RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM75PA6NK02 468 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 TGM5O43548 720 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHGA12O60330 932 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 PLS3P13797 630 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 IFNGR1P15260 489 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.62□□□□□ -1.195e-13■□□□□ 9
RABGGTB-209ENST00000473406 CTSKP43235 329 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 RAC1P63000 192 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 HTRA3P83110 453 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 POU5F1BQ06416 359 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 GALEQ14376 348 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM83BQ5T0W9 1011 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 ERAP2Q6P179 960 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 AMOTL1Q8IY63 956 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 PANK1Q8TE04 598 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 IPPKQ9H8X2 491 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 C1orf112Q9NSG2 853 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 CLEC1BQ9P126 229 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNH3Q9ULD8 1083 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 INVSQ9Y283 1065 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0A0MRY4 1105 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 NPHP1O15259 732 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 OIP5O43482 229 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 TCEA3O75764 348 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 GRK2P25098 689 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINB3P29508 390 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 SCAND1P57086 179 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 IQCEQ6IPM2 695 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 DTWD2Q8NBA8 298 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 GPATCH2Q9NW75 528 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL33A6NCF5 533 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 H7C1D1 291 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 PMM2O15305 246 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 GRK3P35626 688 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 TERF2Q15554 542 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 CLUL1Q15846 466 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 OTOP1Q7RTM1 612 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 RASSF3Q86WH2 238 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 GJA10Q969M2 543 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 TEKT5Q96M29 485 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 LGR6Q9HBX8 967 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 PHTF1Q9UMS5 762 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 TBX3O15119 743 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAMTS2O95450 1211 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 EOMESO95936 686 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 USP11P51784 963 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 GJA9P57773 515 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 ACAP2Q15057 778 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 ANO1Q5XXA6 986 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 CMIPQ8IY22 773 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 Q96M66 194 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 BOCQ9BWV1 1114 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 HDAC8Q9BY41 377 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 CBLCQ9ULV8 474 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 AP1G1O43747 822 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT37O76014 449 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 LSP1P33241 339 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 PREPP48147 710 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAPPC10P48553 1259 aa7.58□□□□□ -1.2
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