RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 LRRC37A2A6NM11 1700 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 BRCA2P51587 3418 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 FAM205CA6NFA0 338 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 CCL5P13501 91 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 PDCP20941 246 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF76P36508 570 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 SREBF1P36956 1147 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 ADCYAP1R1P41586 468 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 ARHGAP4P98171 946 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 ANO1Q5XXA6 986 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 MCTP1Q6DN14 999 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 KRT25Q7Z3Z0 450 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 TBCKQ8TEA7 893 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 TNFRSF25Q93038 417 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 KATNBL1Q9H079 304 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 RNF208Q9H0X6 261 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 VTA1Q9NP79 307 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 PDGFCQ9NRA1 345 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 NRBP1Q9UHY1 535 aa10.08□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 MCM3APO60318 1980 aa10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 KIF28PB7ZC32 967 aa10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 SEPT4O43236 478 aa10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 RGS20O76081 388 aa10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 SYT1P21579 422 aa10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 INF2Q27J81 1249 aa10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC144BQ3MJ40 725 aa10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM63BQ5T3F8 832 aa10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 TAPT1Q6NXT6 567 aa10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 XRRA1Q6P2D8 792 aa10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 TNS4Q8IZW8 715 aa10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 CYP2W1Q8TAV3 490 aa10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 WDR11Q9BZH6 1224 aa10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 FAM184BQ9ULE4 1060 aa10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 MRVI1Q9Y6F6 885 aa10.07□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 ADCY6O43306 1168 aa10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 SORBS3O60504 671 aa10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 STAM2O75886 525 aa10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 CYP3A4P08684 503 aa10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 AKR1A1P14550 325 aa10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 ITGB5P18084 799 aa10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 PTGS1P23219 599 aa10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 TNFAIP2Q03169 654 aa10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 LETM2Q2VYF4 491 aa10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 GNPTABQ3T906 1256 aa10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 NLRX1Q86UT6 975 aa10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 NOSTRINQ8IVI9 506 aa10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 SCFD2Q8WU76 684 aa10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 CRYGNQ8WXF5 182 aa10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 DEFB118Q96PH6 123 aa10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa10.06□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 FAM86B1E9PN63 330 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 STX6O43752 255 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 EDIL3O43854 480 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 ARIH2O95376 493 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 FAM86B2P0C5J1 330 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 TXNP10599 105 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 RARBP10826 455 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 SMPD1P17405 629 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 ATP2B1P20020 1258 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 USP11P51784 963 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 MTMR1Q13613 665 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 TTLL4Q14679 1199 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 LY6KQ17RY6 165 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 CEP55Q53EZ4 464 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 PRR16Q569H4 304 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 IQSEC1Q6DN90 963 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 NEK8Q86SG6 692 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 FERMT3Q86UX7 667 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 ABHD8Q96I13 439 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 UIMC1Q96RL1 719 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 MXRA8Q9BRK3 442 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 JADE2Q9NQC1 790 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 PKD2L1Q9P0L9 805 aa10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa10.04□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 MEIS1O00470 390 aa10.04□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 FIBPO43427 364 aa10.04□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CASQ1-202ENST00000467691 TDP2O95551 362 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms