RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 MMP19Q99542 508 aa27.48■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa27.48■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 VWA3AA6NCI4 1184 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 FCER1AP12319 257 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 KCTD2Q14681 263 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 FAM133AQ8N9E0 248 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 HAS1Q92839 578 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 CSRNP2Q9H175 543 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa27.47■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 POTEB2H3BUK9 544 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 CA12O43570 354 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 MBD3O95983 291 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 LIG1P18858 919 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 KLHL40Q2TBA0 621 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 CEP55Q53EZ4 464 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 SPECC1Q5M775 1068 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 DNERQ8NFT8 737 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 KCNMB3Q9NPA1 279 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 PCNTO95613 3336 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 PGK2P07205 417 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 CMA1P23946 247 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 DTHD1Q6ZMT9 781 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-209ENST00000460297 SOWAHBA6NEL2 793 aa27.45■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 NR3C2P08235 984 aa27.45■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 ITGB5P18084 799 aa27.45■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 VEGFBP49765 207 aa27.45■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 RESP18Q5W5W9 173 aa27.45■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 VSIG10LQ86VR7 867 aa27.45■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 FSIP1Q8NA03 581 aa27.45■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 ETNPPLQ8TBG4 499 aa27.45■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 GJA10Q969M2 543 aa27.45■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 MXRA8Q9BRK3 442 aa27.45■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 A0A1B0GVL5 298 aa27.44■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 MEIS1O00470 390 aa27.44■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 TXKP42681 527 aa27.44■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 UIMC1Q96RL1 719 aa27.44■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa27.44■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa27.44■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 ALDH1A1P00352 501 aa27.43■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 USP49Q70CQ1 688 aa27.43■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 GPR142Q7Z601 462 aa27.43■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 PLA2G4DQ86XP0 818 aa27.43■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 FGD4Q96M96 766 aa27.43■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 MSH4O15457 936 aa27.43■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 STRNO43815 780 aa27.43■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 CCND2P30279 289 aa27.43■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 MAPK4P31152 587 aa27.43■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 XRRA1Q6P2D8 792 aa27.43■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 DOCK3Q8IZD9 2030 aa27.42■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 TBX3O15119 743 aa27.42■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 ABRAQ8N0Z2 381 aa27.42■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 IWS1Q96ST2 819 aa27.42■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa27.42■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa27.42■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 LRRC37A2A6NM11 1700 aa27.41■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 NR1I2O75469 434 aa27.41■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 ARP10275 920 aa27.41■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 PFKFB1P16118 471 aa27.41■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 ADORA2AP29274 412 aa27.41■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 LONP1P36776 959 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 TECP42680 631 aa27.41■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 NDUFA8P51970 172 aa27.41■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 NIPA1Q7RTP0 329 aa27.41■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 ENGASEQ8NFI3 743 aa27.41■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 EPSTI1Q96J88 318 aa27.41■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 WDR11Q9BZH6 1224 aa27.41■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 HPSEQ9Y251 543 aa27.41■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 MAP2K2P36507 400 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP27.4■■□□□ 1.984e-6■■■■□ 23.1
NME4-209ENST00000460297 SETQ01105 290 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 PLEKHH3Q7Z736 793 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 JADE2Q9NQC1 790 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 MARCH6O60337 910 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 COBLO75128 1261 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 EDNRBP24530 442 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 SLFN12Q8IYM2 578 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 IGSF22Q8N9C0 903 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 FAM20AQ96MK3 541 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 MCM3APO60318 1980 aa27.39■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 THSD7BQ9C0I4 1608 aa27.39■■□□□ 1.98
NME4-209ENST00000460297 FAM160A1Q05DH4 1040 aa27.39■■□□□ 1.97
NME4-209ENST00000460297 GRB14Q14449 540 aa27.39■■□□□ 1.97
NME4-209ENST00000460297 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
NME4-209ENST00000460297 KCNH7Q9NS40 1196 aa27.39■■□□□ 1.97
NME4-209ENST00000460297 DACT1Q9NYF0 836 aa27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms